bioinformatics पर टैग किए गए जवाब

मार्कोव चेन और एचएमएम के बारे में जानने के लिए मैं संसाधनों (ट्यूटोरियल, पाठ्यपुस्तकों, वेबकास्ट आदि) की तलाश कर रहा हूं। मेरी पृष्ठभूमि एक जीवविज्ञानी के रूप में है, और मैं वर्तमान में एक जैव सूचना विज्ञान-संबंधित परियोजना में शामिल हूं। इसके अलावा, मार्कोव मॉडल और एचएमएम की पर्याप्त समझ …

57 references  markov-process  hidden-markov-model  bioinformatics 

मुझे आश्चर्य हो रहा है कि क्या यह व्याख्या में फर्क करता है कि क्या केवल आश्रित, आश्रित और स्वतंत्र, या केवल स्वतंत्र चर ही रूपांतरित हैं। के मामले पर विचार करें log(DV) = Intercept + B1*IV + Error मैं IV की व्याख्या प्रतिशत वृद्धि के रूप में कर सकता …

46 regression  data-transformation  interpretation  regression-coefficients  logarithm  r  dataset  stata  hypothesis-testing  contingency-tables  hypothesis-testing  statistical-significance  standard-deviation  unbiased-estimator  t-distribution  r  functional-data-analysis  maximum-likelihood  bootstrap  regression  change-point  regression  sas  hypothesis-testing  bayesian  randomness  predictive-models  nonparametric  terminology  parametric  correlation  effect-size  loess  mean  pdf  quantile-function  bioinformatics  regression  terminology  r-squared  pdf  maximum  multivariate-analysis  references  data-visualization  r  pca  r  mixed-model  lme4-nlme  distributions  probability  bayesian  prior  anova  chi-squared  binomial  generalized-linear-model  anova  repeated-measures  t-test  post-hoc  clustering  variance  probability  hypothesis-testing  references  binomial  profile-likelihood  self-study  excel  data-transformation  skewness  distributions  statistical-significance  econometrics  spatial  r  regression  anova  spss  linear-model 

नकारात्मक द्विपद (NB) वितरण को गैर-नकारात्मक पूर्णांक पर परिभाषित किया गया है और इसमें प्रायिकता मास फ़ंक्शनक्या यह एक ही सूत्र द्वारा परिभाषित गैर-नकारात्मक वास्तविक पर निरंतर वितरण पर विचार करने के लिए समझ में आता है ( k_ in \ mathbb N_0 द्वारा x \ द्वारा \ mathbb R …

24 distributions  negative-binomial  count-data  continuous-data  bioinformatics 

मुझे पता है कि मेरा प्रश्न / शीर्षक बहुत विशिष्ट नहीं है, इसलिए मैं इसे स्पष्ट करने का प्रयास करूंगा: कृत्रिम तंत्रिका नेटवर्क में अपेक्षाकृत सख्त डिजाइन होते हैं। बेशक, आम तौर पर, वे जीव विज्ञान से प्रभावित होते हैं और वास्तविक तंत्रिका नेटवर्क के गणितीय मॉडल का निर्माण करने …

24 machine-learning  neural-networks  bioinformatics  artificial-intelligence  neuroscience 

अभी हाल ही में, मैंने दो लेख पढ़े। पहला सहसंबंध के इतिहास के बारे में है और दूसरा नई विधि के बारे में है जिसे मैक्सिमल इन्फ़ॉर्मेशन कोएफ़िशिएंसी (एमआईसी) कहा जाता है। चर के बीच गैर-रेखीय सहसंबंधों का अनुमान लगाने के लिए एमआईसी पद्धति को समझने के लिए मुझे आपकी …

20 correlation  nonparametric  bioinformatics  information-theory  mutual-information 

मेरे पास अत्यधिक असंतुलित परीक्षण डेटा सेट है। सकारात्मक सेट में 100 मामले होते हैं जबकि नकारात्मक सेट में 1500 मामले होते हैं। प्रशिक्षण पक्ष में, मेरे पास एक बड़ा उम्मीदवार पूल है: सकारात्मक प्रशिक्षण सेट में 1200 मामले हैं और नकारात्मक प्रशिक्षण सेट में 12000 मामले हैं। इस तरह …

16 machine-learning  classification  data-mining  svm  bioinformatics 

ऋणात्मक द्विपद वितरण जैव सूचना विज्ञान में गणना डेटा के लिए एक लोकप्रिय मॉडल बन गया है (विशेषकर अनुक्रमण की अपेक्षित संख्या जीनोम के किसी दिए गए क्षेत्र के भीतर पढ़ती है)। स्पष्टीकरण भिन्न हैं: कुछ इसे कुछ के रूप में समझाते हैं जो पॉइसन वितरण की तरह काम करता …

16 poisson-distribution  negative-binomial  bioinformatics  sequence-analysis 

यह मशीन सीखने की शुरुआत करने वाले किसी व्यक्ति से एक भोला सवाल है। मैं इन दिनों मार्सलैंड की पुस्तक "मशीन लर्निंग: एन अल्गोरिथमिक परिप्रेक्ष्य" पढ़ रहा हूं। मुझे यह एक परिचयात्मक पुस्तक के रूप में उपयोगी लगता है, लेकिन अब मैं उन्नत एल्गोरिदम में जाना चाहूंगा, जो वर्तमान में …

14 machine-learning  clustering  bioinformatics 

मैंने हाल ही में मेडिकल और बायोलॉजिकल मॉडलिंग में अपनी स्नातकोत्तर डिग्री के साथ इंजीनियरिंग गणित के साथ एक पृष्ठभूमि के रूप में स्नातक किया है। भले ही मेरे शिक्षा कार्यक्रम में गणितीय आंकड़ों पर एक महत्वपूर्ण मात्रा में पाठ्यक्रम शामिल थे (एक सूची के लिए नीचे देखें), जिसे मैंने …

13 mathematical-statistics  bioinformatics  computational-statistics 

उम्मीद है कि इन मंचों पर कोई व्यक्ति जीन अभिव्यक्ति अध्ययन में इस बुनियादी समस्या से निपटने में मेरी मदद कर सकता है। मैंने एक प्रायोगिक और एक नियंत्रण ऊतक की गहरी अनुक्रमण किया। मैंने तब नियंत्रण में प्रायोगिक नमूने में जीन के गुना संवर्धन मूल्यों को प्राप्त किया। संदर्भ …

13 r  genetics  bioinformatics  microarray  biostatistics 

जैविक पृष्ठभूमि समय के साथ, कुछ पौधों की प्रजातियां अपने पूरे जीनोम की नकल करती हैं, प्रत्येक जीन की एक अतिरिक्त प्रति प्राप्त करती हैं। इस सेटअप की अस्थिरता के कारण, इन जीनों में से कई को हटा दिया जाता है, और जीनोम खुद को फिर से व्यवस्थित करता है …

11 generalized-linear-model  contingency-tables  fishers-exact  genetics  bioinformatics 

एक आनुवांशिक संघ अध्ययन में कोवरिएट्स के रूप में उम्र और उम्र-वर्ग का उपयोग क्यों करेगा? मैं उम्र के उपयोग को समझ सकता हूं अगर इसे एक महत्वपूर्ण कोवरिएट के रूप में पहचाना गया है, लेकिन मैं उम्र-वर्ग के उपयोग के रूप में नुकसान में हूं।

11 multiple-regression  polynomial  predictor  bioinformatics  genetics 

मेरे पास फॉर्म का GLMM है: lmer(present? ~ factor1 + factor2 + continuous + factor1*continuous + (1 | factor3), family=binomial) जब मैं उपयोग करता हूं drop1(model, test="Chi"), तो मुझे Anova(model, type="III")कार के पैकेज से उपयोग करने की तुलना में अलग-अलग परिणाम मिलते हैं या summary(model)। ये उत्तरार्द्ध दो ही जवाब …

10 r  anova  glmm  r  mixed-model  bootstrap  sample-size  cross-validation  roc  auc  sampling  stratification  random-allocation  logistic  stata  interpretation  proportion  r  regression  multiple-regression  linear-model  lm  r  cross-validation  cart  rpart  logistic  generalized-linear-model  econometrics  experiment-design  causality  instrumental-variables  random-allocation  predictive-models  data-mining  estimation  contingency-tables  epidemiology  standard-deviation  mean  ancova  psychology  statistical-significance  cross-validation  synthetic-data  poisson-distribution  negative-binomial  bioinformatics  sequence-analysis  distributions  binomial  classification  k-means  distance  unsupervised-learning  euclidean  correlation  chi-squared  spearman-rho  forecasting  excel  exponential-smoothing  binomial  sample-size  r  change-point  wilcoxon-signed-rank  ranks  clustering  matlab  covariance  covariance-matrix  normal-distribution  simulation  random-generation  bivariate  standardization  confounding  z-statistic  forecasting  arima  minitab  poisson-distribution  negative-binomial  poisson-regression  overdispersion  probability  self-study  markov-process  estimation  maximum-likelihood  classification  pca  group-differences  chi-squared  survival  missing-data  contingency-tables  anova  proportion 

हम हमेशा कहते हैं कि आंकड़े केवल डेटा के साथ काम कर रहे हैं। लेकिन हम यह भी जानते हैं कि सूचना विश्लेषण को डेटा विश्लेषण से भी ज्ञान मिल रहा है। उदाहरण के लिए, बायोइनफॉरमैटिक्स लोग पूरी तरह से बायोस्टैटिस्टिक्स के बिना जा सकते हैं। मैं जानना चाहता हूं …

10 bioinformatics 

उदाहरण: मेरे पास नौकरी के विवरण में एक वाक्य है: "यूके में जावा वरिष्ठ इंजीनियर"। मैं इसे 2 श्रेणियों के रूप में भविष्यवाणी करने के लिए एक गहरे शिक्षण मॉडल का उपयोग करना चाहता हूं: English और IT jobs। यदि मैं पारंपरिक वर्गीकरण मॉडल का उपयोग करता हूं, तो यह …

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