lme4-nlme पर टैग किए गए जवाब

lme4 और nlme आर पैकेज हैं जिनका इस्तेमाल लीनियर, सामान्यीकृत लीनियर और नाइलिनियर मिश्रित प्रभाव वाले मॉडल को फिट करने के लिए किया जाता है। मिश्रित मॉडल के बारे में सामान्य प्रश्नों के लिए [मिश्रित-मॉडल] टैग का उपयोग करें।

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ग्लैमर में यादृच्छिक प्रभाव विचरण की व्याख्या करना
मैं परागण पर एक पेपर को संशोधित कर रहा हूं, जहां डेटा द्विपद रूप से वितरित किए जाते हैं (फल परिपक्व होते हैं या नहीं)। इसलिए मैंने glmerएक यादृच्छिक प्रभाव (व्यक्तिगत संयंत्र) और एक निश्चित प्रभाव (उपचार) के साथ उपयोग किया। एक समीक्षक यह जानना चाहता है कि क्या पौधे …

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Nakagawa & Schielzeth (2013) R2glmm विधि का उपयोग करके मिश्रित मॉडल में गणना
मैं मिश्रित मॉडलों में मानों की गणना के बारे में पढ़ रहा हूं और R-sig FAQ पढ़ने के बाद, इस मंच पर अन्य पोस्ट (मैं कुछ लिंक करूंगा लेकिन मेरे पास पर्याप्त प्रतिष्ठा नहीं है) और कई अन्य संदर्भ मुझे समझ में आए मिश्रित मॉडल के संदर्भ में मान जटिल …

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गैर-रेखीय मिश्रित मॉडल (nlme) के पूर्वानुमानों पर विश्वास अंतराल
मैं एक गैर-रेखीय मिश्रित nlmeमॉडल की भविष्यवाणियों पर 95% विश्वास अंतराल प्राप्त करना चाहूंगा । जैसा कि इसके भीतर करने के लिए कुछ भी मानक प्रदान नहीं किया गया है nlme, मैं सोच रहा था कि क्या "जनसंख्या पूर्वानुमान अंतराल" की विधि का उपयोग करना सही है, जैसा कि बेन …

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डिफ़ॉल्ट lme4 अनुकूलक को उच्च-आयामी डेटा के लिए बहुत सारे पुनरावृत्तियों की आवश्यकता होती है
टी एल; डॉ: lme4अनुकूलन डिफ़ॉल्ट रूप से मॉडल पैरामीटर की संख्या में रेखीय प्रतीत होता है, और है जिस तरह से एक बराबर की तुलना में धीमी glmसमूहों के लिए डमी चर के साथ मॉडल। वहाँ कुछ भी है मैं इसे गति कर सकता हूँ? मैं एक काफी बड़े पदानुक्रमित …

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SAS PROC GLIMMIX मुझे एक द्विपद शुक्राणु के लिए ग्लमर (lme4) की तुलना में बहुत अलग यादृच्छिक ढलान क्यों देता है
मैं आर के साथ अधिक परिचित हूं, और चार निवास स्थानों के लिए 5 वर्षों में लगभग 35 व्यक्तियों के लिए यादृच्छिक ढलान (चयन गुणांक) का अनुमान लगाने की कोशिश कर रहा हूं। प्रतिक्रिया चर है कि क्या कोई स्थान "उपयोग किया गया था" (1) या "उपलब्ध" (0) निवास स्थान …

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Lmer मॉडल अभिसरण करने में विफल रहता है
मेरे डेटा का वर्णन यहां किया गया है जब एक दोहराया उपायों ANOVA को फिट करने पर "त्रुटि () मॉडल एकल में त्रुटि" हो सकती है? मैं lmerअपने आधार मामले का उपयोग करते हुए एक इंटरैक्शन के प्रभाव को देखने की कोशिश कर रहा हूं : my_null.model <- lmer(value ~ …
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मिश्रित प्रभावों के साथ गिनती डेटा के लिए अच्छा मॉडल खोजने में परेशानी - ZINB या कुछ और?
मेरे पास एकान्त मधुमक्खी बहुतायत पर एक बहुत छोटा डेटा सेट है जिसका मुझे विश्लेषण करने में परेशानी हो रही है। यह डेटा की गणना है, और लगभग सभी गणना एक उपचार में हैं जिनमें से अधिकांश शून्य अन्य उपचार में हैं। बहुत उच्च मूल्यों के एक जोड़े भी हैं …

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Lmer और p-values ​​पर भ्रम: MCMC वालों की तुलना में मेमिस पैकेज से p-मान कैसे करते हैं?
मैं इस धारणा के तहत था कि पैकेज lmer()में फ़ंक्शन lme4पी-वैल्यू (देखें lmer, पी-वैल्यू और सब कुछ ) का उत्पादन नहीं करता है । : मैं बजाय के रूप में इस सवाल का प्रति एमसीएमसी उत्पन्न पी मानों का उपयोग किया गया है में महत्वपूर्ण प्रभाव lme4मिश्रित मॉडल और इस …

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हिडन मार्कोव मॉडल में "सर्वश्रेष्ठ" मॉडल का चयन करने के लिए मानदंड
मेरे पास एक समय श्रृंखला डेटा सेट है, जिसमें मैं डेटा में अव्यक्त राज्यों की संख्या का अनुमान लगाने के लिए एक छिपे हुए मार्कोव मॉडल (एचएमएम) को फिट करने की कोशिश कर रहा हूं। ऐसा करने के लिए मेरा छद्म कोड निम्नलिखित है: for( i in 2 : max_number_of_states …

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मिश्रित मॉडल प्रति स्तर 1 अवलोकन के साथ
मैं glmerकुछ व्यावसायिक डेटा के साथ एक यादृच्छिक प्रभाव मॉडल फिट कर रहा हूं । उद्देश्य वितरक द्वारा बिक्री के प्रदर्शन का विश्लेषण करना है, क्षेत्रीय विविधता को ध्यान में रखते हुए। मेरे पास निम्नलिखित चर हैं: distcode: वितरक आईडी, लगभग 800 स्तरों के साथ region: शीर्ष-स्तरीय भौगोलिक आईडी (उत्तर, …

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पोस्मोन GLMM में लार () के साथ आर में अतिप्रवाह के लिए परीक्षण कैसे करें?
मेरे पास निम्न मॉडल है: > model1<-lmer(aph.remain~sMFS1+sAG1+sSHDI1+sbare+season+crop +(1|landscape),family=poisson) ... और यह सारांश आउटपुट है। > summary(model1) Generalized linear mixed model fit by the Laplace approximation Formula: aph.remain ~ sMFS1 + sAG1 + sSHDI1 + sbare + season + crop + (1 | landscape) AIC BIC logLik deviance 4057 4088 -2019 …

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मैं एक गैर-मिश्रित मिश्रित प्रभाव मॉडल फिट करूं जो कि बार-बार किए गए उपायों के डेटा के लिए nlmer () का उपयोग कर फिट हो?
मैं बार-बार माप डेटा का विश्लेषण करने की कोशिश कर रहा हूं और इसे काम करने के लिए संघर्ष कर रहा हूं R। मेरा डेटा अनिवार्य रूप से निम्नलिखित है, मेरे पास दो उपचार समूह हैं। प्रत्येक समूह में हर विषय का हर रोज परीक्षण किया जाता है और उसे …

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एक साथ परीक्षण और अनुदैर्ध्य मिश्रित मॉडल में समय-अलग-अलग सहसंयोजकों के साथ प्रभावों का परीक्षण
मुझे हाल ही में बताया गया था कि इन सहसंयोजकों के लिए समय अंतराल शुरू किए बिना अनुदैर्ध्य मिश्रित मॉडल में समय-अलग-अलग covariates को शामिल करना संभव नहीं था। क्या आप इसकी पुष्टि / खंडन कर सकते हैं? क्या आपके पास इस स्थिति पर कोई संदर्भ है? मैं स्पष्ट करने …

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स्वतंत्रता से डिग्री प्राप्त करना
मैंने निम्नलिखित के साथ एक lmer मॉडल फिट किया है (यद्यपि आउटपुट बना है): Random effects: Groups Name Std.Dev. day:sample (Intercept) 0.09 sample (Intercept) 0.42 Residual 0.023 मैं वास्तव में निम्नलिखित सूत्र का उपयोग करके प्रत्येक प्रभाव के लिए एक विश्वास अंतराल बनाना चाहता हूं: ( एन - 1 ) …

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पूर्ण सफलताओं के साथ एक स्पष्ट चर के साथ द्विपद ग्लोम
मैं एक द्विपद प्रतिक्रिया चर और एक श्रेणीबद्ध भविष्यवक्ता के साथ एक चमक चला रहा हूं। यादृच्छिक प्रभाव डेटा संग्रह के लिए उपयोग किए गए नेस्टेड डिज़ाइन द्वारा दिया जाता है। डेटा इस तरह दिखता है: m.gen1$treatment [1] sucrose control protein control no_injection ..... Levels: no_injection control sucrose protein m.gen1$emergence …

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