पोस्मोन GLMM में लार () के साथ आर में अतिप्रवाह के लिए परीक्षण कैसे करें?


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मेरे पास निम्न मॉडल है:

> model1<-lmer(aph.remain~sMFS1+sAG1+sSHDI1+sbare+season+crop
  +(1|landscape),family=poisson)

... और यह सारांश आउटपुट है।

> summary(model1)
Generalized linear mixed model fit by the Laplace approximation 
Formula: aph.remain ~ sMFS1 + sAG1 + sSHDI1 + sbare + season + crop 
         +      (1 | landscape) 
  AIC  BIC logLik deviance
 4057 4088  -2019     4039
Random effects:
 Groups    Name        Variance Std.Dev.
 landscape (Intercept) 0.74976  0.86588 
Number of obs: 239, groups: landscape, 45

Fixed effects:
              Estimate Std. Error z value Pr(>|z|)    
(Intercept)  2.6613761  0.1344630  19.793  < 2e-16 
sMFS1        0.3085978  0.1788322   1.726  0.08441   
sAG1         0.0003141  0.1677138   0.002  0.99851    
sSHDI1       0.4641420  0.1619018   2.867  0.00415 
sbare        0.4133425  0.0297325  13.902  < 2e-16 
seasonlate  -0.5017022  0.0272817 -18.390  < 2e-16 
cropforage   0.7897194  0.0672069  11.751  < 2e-16
cropsoy      0.7661506  0.0491494  15.588  < 2e-16 

                  

Correlation of Fixed Effects:
           (Intr) sMFS1  sAG1   sSHDI1 sbare  sesnlt crpfrg
sMFS1      -0.007                                          
sAG1        0.002 -0.631                                   
sSHDI1      0.000  0.593 -0.405                            
sbare      -0.118 -0.003  0.007 -0.013                     
seasonlate -0.036  0.006 -0.006  0.003 -0.283              
cropforage -0.168 -0.004  0.016 -0.014  0.791 -0.231       
cropsoy    -0.182 -0.028  0.030 -0.001  0.404 -0.164  0.557

यह शायद अतिविशिष्ट है, लेकिन मैं वास्तव में इसकी गणना कैसे करूं?

बहुत बहुत धन्यवाद।



4
मैं अच्छी तरह से lme4 पैकेज का उपयोग करने में निपुण नहीं हूं, लेकिन यह पता लगाने का एक तरीका है कि पॉइज़न मॉडल के साथ काम करते समय ओवरडिपर्ट्स है या नहीं, यह अवशिष्ट अवशिष्टता की तुलना स्वतंत्रता के अवशिष्ट डिग्री से करना है। इन्हें एक जैसा माना जाता है, इसलिए यदि अवशिष्ट अवतरण स्वतंत्रता की अवशिष्ट डिग्री से अधिक है, तो यह अतिविशिष्टता का संकेत है। समतुल्यता की धारणा का कैमरन और त्रिवेदी परीक्षण भी है, लेकिन फिर से, मुझे यकीन नहीं है कि यह lme4 पैकेज द्वारा किया जा सकता है।
ग्रीम वाल्श

3
qcc.overdispersion.test@ पेंगुइन_ रात : ऐसा नहीं लगता कि यह उचित है (यह कच्चे द्विपद डेटा में अतिविशिष्टता के लिए परीक्षण करता है, एक मॉडल में नहीं)
बेन बोल्कर

जवाबों:


4

GLMM पर lmer () और अन्य GLMM फिटिंग सॉफ्टवेयर के साथ कई अन्य उपयोगी tidbits के अलावा, निम्नलिखित वेब पेज पर अनुभाग की जांच करें जिसे मैं GLMM में ओवरडिपर्ट्स से कैसे निपट सकता हूं?

http://glmm.wikidot.com/faq


यह एक उत्तर की तुलना में अधिक टिप्पणी है। क्या आप इसका विस्तार कर सकते हैं, शायद लिंक पर जानकारी का सारांश देकर?
गुंग - को पुनः स्थापित मोनिका

0

एईआर (p.33) के पैकेज में भूमध्यसागरीयता की धारणा का कैमरन और त्रिवेदी परीक्षण है जिसका उपयोग GLM के साथ किया जा सकता है।

AER::dispersiontest(model1)

2
यद्यपि कार्यान्वयन को अक्सर प्रश्नों में महत्वपूर्ण सामग्री के साथ मिलाया जाता है, हमें आँकड़े, मशीन सीखने आदि के बारे में जानकारी प्रदान करने के लिए एक साइट माना जाता है, कोड नहीं। यह कोड प्रदान करने के लिए अच्छा हो सकता है, लेकिन कृपया उन लोगों के लिए पाठ में अपने उत्तर को विस्तृत करें, जो कोड से उत्तर को पहचानने और निकालने के लिए इस भाषा को अच्छी तरह से नहीं पढ़ते हैं।
गुंग - को पुनः स्थापित मोनिका
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