कॉक्स PH मॉडल से बचने के समय के संदर्भ में भविष्यवाणियां कैसे करें?


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मैं उन प्रतिभागियों के डेटासेट में सर्व-मृत्यु दर के लिए एक भविष्यवाणी मॉडल (कॉक्स पीएच) विकसित करना चाहता हूं, जिनके (लगभग) सभी फॉलो-अप के अंत में मृत्यु हो गई है (जैसे 1-वर्ष)।

एक निश्चित समय-बिंदु पर मरने के पूर्ण जोखिम की भविष्यवाणी करने के बजाय, मैं प्रत्येक व्यक्ति के लिए जीवित रहने के समय (महीनों में) की भविष्यवाणी करना चाहूंगा।

क्या इस तरह की भविष्यवाणियों को आर में प्राप्त करना संभव है (उदाहरण के लिए एक कॉक्सफ-ऑब्जेक्ट) और, यदि हां, तो मैं यह कैसे कर सकता हूं?

अग्रिम में बहुत धन्यवाद!

जवाबों:


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कॉक्स आनुपातिक खतरा मॉडल अंतर्निहित खतरे को मॉडल नहीं करता है, जो कि आपको जीवित रहने के समय की भविष्यवाणी करने की आवश्यकता है जैसे - यह मॉडल की महान शक्ति और यह एक बड़ी कमियां है।

यदि आप विशेष समय बिंदुओं पर अस्तित्व की संभावना के अनुमान प्राप्त करने में विशेष रूप से रुचि रखते हैं, तो मैं आपको पैरामीट्रिक उत्तरजीविता मॉडल (उर्फ त्वरित विफलता समय मॉडल) की ओर इंगित करता हूं। ये survivalआर के लिए पैकेज में लागू किए गए हैं , और आपको पैरामीट्रिक उत्तरजीविता समय वितरण प्रदान करेंगे, जिसमें आप बस उस समय को प्लग कर सकते हैं जिसमें आप रुचि रखते हैं और एक जीवित रहने की संभावना वापस पा सकते हैं।


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आपके उत्तर के लिए धन्यवाद। मैं किसी विशेष समय में अस्तित्व की संभावना के अनुमान प्राप्त करने में विशेष रूप से दिलचस्पी नहीं रखता, बल्कि प्रत्येक व्यक्ति के लिए अनुमानित अस्तित्व के समय में। इसलिए उदाहरण के लिए '1 वर्ष में जीवित रहने की संभावना 10% है' के बजाय, मैं 'इस व्यक्ति की अनुमानित उत्तरजीविता का समय 10 महीने है' जैसी भविष्यवाणियां करना चाहता हूं। क्या कॉक्स PH या AFT मॉडल से ऐसी भविष्यवाणियां करना संभव है?
राब

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@ मुझे लगता है कि यह अभी भी एक कॉक्स PH मॉडल में काम करने योग्य नहीं है। यह एएफटी मॉडल के साथ पूरी तरह से उल्लेखनीय है, हालांकि एक अनुमान वापस पाने की जटिलता संभवतः इस बात पर निर्भर करेगी कि आपके पास कितने कोवरिएट्स हैं।
फोमाइट

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धन्यवाद, मैं एएफटी मॉडल में देखूंगा। मैं व्यक्तिगत अस्तित्व के समय की भविष्यवाणी के बारे में पढ़ रहा हूं, लेकिन ऐसा लगता है कि "मानव अस्तित्व इतना अनिश्चित है कि सर्वश्रेष्ठ सांख्यिकीय विश्लेषण भी व्यक्तिगत रोगियों के लिए वास्तविक उपयोग की एकल-संख्या की भविष्यवाणी प्रदान नहीं कर सकता है।" ( लिंक ) ..
रोब

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@ रब सही है - ये सभी तकनीक आबादी में रुझानों के बारे में बात करते हैं । किसी भी व्यक्ति की सटीक भविष्यवाणी का प्रयास करना एक खो जाने का कारण है, और वास्तव में उपकरण का एक उपयुक्त उपयोग नहीं है।
फोमाइट

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उपलब्ध साहित्य को देखते हुए, मुझे लगता है कि आप व्यक्तिगत अस्तित्व के समय की भविष्यवाणी के बारे में सही हैं। हालांकि, कॉक्स और एएफटी दोनों मॉडल निश्चित समय बिंदुओं पर व्यक्तिगत निरपेक्ष जोखिम की भविष्यवाणी के लिए निश्चित रूप से उपयुक्त उपकरण हैं (उदाहरण के लिए हर्रेल और स्टेयरबर्ग द्वारा पुस्तकें देखें )।
रोब

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@statBeginner हाँ यह होगा। इसके लिए दो चरणों की आवश्यकता है:

x <- survfit(cox.ph.model, newdata = dataset)
dataset$Results <- summary(x)$table[,"median"]

लेकिन मुझे यकीन नहीं है कि उत्तरजीविता के लिए माध्य समय पर्याप्त है।


मैं @ आकाश के साथ सहमत हूं कि मध्ययुगीन जीवित रहने का समय, उपयोगी होने पर, व्यक्तिगत मामलों के लिए उपयुक्त नहीं हो सकता है, खासकर अगर घटना के समय की भविष्यवाणी कर रहा हो। व्यक्तिगत उत्तरजीविता का समय अविश्वसनीय रूप से विषम हो सकता है इसलिए मैं भविष्यवाणी के लिए किसी भी माध्य अस्तित्व के समय का उपयोग करते हुए सावधानी बरतने की सलाह दूंगा।
सीनोसैपियन

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हालांकि मैं इन बिंदुओं से सहमत हूं, मध्यजीविता अस्तित्व के नैदानिक ​​रूप से उपयोगी है।

आप हमारे काम में दिलचस्पी ले सकते हैं (और अन्य) उत्तरजीविता अंतराल के आधार के रूप में माध्यिका का उपयोग करते हुए देख रहे हैं - हमें लगता है कि ये अधिक उपयोगी हैं।

https://academic.oup.com/annonc/article/25/10/2014/2801274


माध्य अस्तित्व हमेशा मौजूद नहीं हो सकता है, लेकिन मंझला हमेशा करता है।
माइकल आर। चेरिक
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