जीव विज्ञान, मनोविज्ञान और चिकित्सा में lmer का उपयोग करके मिश्रित-मॉडल विश्लेषण के लिए उदाहरण रिपोर्ट?


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जैसा कि आम सहमति lmer()शास्त्रीय ANOVA (अक्सर उद्धृत कारणों की तरह, असंतुलित डिजाइन, यादृच्छिक प्रभावों को पार करने के लिए) के बजाय R के माध्यम से मिश्रित-मॉडल का उपयोग करती प्रतीत होती है , मैं इसे अपने डेटा के साथ आज़माना चाहूंगा। हालांकि मुझे चिंता है कि मैं अपने पर्यवेक्षक (जो अंत में एक पी-मूल्य के साथ शास्त्रीय विश्लेषण की उम्मीद कर रहा हूं) या बाद में समीक्षकों के लिए इस दृष्टिकोण को "बेच" सकता हूं।

क्या आप प्रकाशित लेखों के कुछ अच्छे उदाहरणों की सिफारिश कर सकते हैं जो मिश्रित-मॉडल या lmer()विभिन्न डिजाइनों के लिए उपयोग किए जाते हैं जैसे कि बार-उपाय या कई के भीतर और क्षेत्र-जीव विज्ञान, मनोविज्ञान, चिकित्सा के लिए बीच-बीच के डिज़ाइन?


यह भी अच्छा होगा कि संदर्भ के अनुसार कुछ संकेत दिए जाएं जो कि महत्वपूर्ण
माने जाते

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पर lme4 परियोजना पृष्ठ, वहाँ एक है लेख और अन्य अनुसंधान के संग्रह का उपयोग कर nlmeया lme4
CHL

जवाबों:


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अपडेट 3 (मई, 2013): साइकोलॉजी में मिश्रित मॉडल पर एक और बहुत अच्छा पेपर जर्नल ऑफ मेमोरी एंड लैंग्वेज में जारी किया गया था (हालांकि मैं लेखक निष्कर्षों से सहमत नहीं हूं कि पी- कैसे प्राप्त करें , afexइसके बजाय पैकेज देखें )। यह बहुत अच्छी तरह से चर्चा करता है कि यादृच्छिक प्रभाव संरचना को कैसे निर्दिष्ट किया जाए। जाओ इसे पढ़ो!

बर्र, डीजे, लेवी, आर।, शेपर्स, सी।, और टिली, एचजे (2013)। पुष्टित्मक परिकल्पना परीक्षण के लिए यादृच्छिक प्रभाव संरचना: इसे अधिकतम रखेंजर्नल ऑफ़ मेमोरी एंड लैंग्वेज , 68 (3), 255–278। doi: 10.1016 / j.jml.2012.11.001


अद्यतन 2 (जुलाई, 2012): पार किए जाने पर (सामाजिक) मनोविज्ञान में उपयोग की वकालत करने वाला एक कागज (जैसे, प्रतिभागी और आइटम) यादृच्छिक प्रभाव।
बड़ी बात यह है: यह दिखाता है कि pbkrtest पैकेज का उपयोग करके पी-वैल्यू कैसे प्राप्त करें :

जुड, सीएम, वेस्टफॉल, जे।, और केनी, डीए (2012)। सामाजिक मनोविज्ञान में एक यादृच्छिक कारक के रूप में उत्तेजनाओं का इलाज: एक व्यापक और बड़े पैमाने पर अनदेखी समस्या का एक नया और व्यापक समाधान। जर्नल ऑफ़ पर्सनैलिटी एंड सोशल साइकोलॉजी , 103 (1), 54–69। doi: 10.1037 / a0028347 (केवल एक शब्द के रूप में उपलब्ध है। डॉक
)

जेक वेस्टफॉल ने मुझे (प्रति मेल) बताया कि वकालत करने वाले केनवर्ड-रोजर्स सन्निकटन (pbkrtest में प्रयुक्त) के लिए पी-वैल्यू प्राप्त करने का एक विकल्प है (कम इष्टतम) सटरथवेट सन्निकटन, जो फ़ंक्शन का उपयोग करके मिक्समॉड पैकेज में पाया जा सकता है anovaTab

अंतिम अपडेट के लिए छोटा अपडेट: मेरे आर पैकेज afexमें mixed()मिश्रित मॉडल में सभी प्रभावों के लिए आसानी से पी-मान प्राप्त करने के लिए फ़ंक्शन शामिल है । वैकल्पिक रूप से, carपैकेज अब Anova()उपयोग में मिश्रित मॉडल के लिए पी-मान भी प्राप्त करता हैtest.statistic = "F"


UPDATE1: lme4 का वर्णन करने वाला एक और पेपर

क्लीगल, आर।, वी।, पी।, डंबाचर, एम।, यान, एम।, और झोउ, एक्स (2011)। रैखिक मिश्रित मॉडल में प्रायोगिक प्रभाव और व्यक्तिगत अंतर: दृश्य ध्यान में स्थानिक, वस्तु और आकर्षण प्रभावों के बीच संबंध का आकलन करना। मात्रात्मक मनोविज्ञान और माप में फ्रंटियर्स , 1, 238। doi: 10.3389 / fpsyg.2010.00238


मूल प्रतिक्रिया:

मेरे पास कई उदाहरण नहीं हैं, केवल एक (नीचे देखें), लेकिन पता है कि कुछ पेपर आपको मनोविज्ञान / संज्ञानात्मक विज्ञान से उद्धृत करना चाहिए। सबसे महत्वपूर्ण एक निश्चित रूप से है:

बेयेन, आरएच, डेविडसन, डीजे, और बेट्स, डीएम (2008)। विषयों और वस्तुओं के लिए यादृच्छिक प्रभावों के साथ मिश्रित-प्रभाव मॉडलिंग। जर्नल ऑफ़ मेमोरी एंड लैंग्वेज , 59 (4), 390–412। doi: 10.1016 / j.jml.2007.12.005

बायेन का एक और तरीका है:

बेयेन, आरएच, और मिलिन, पी। (2010)। प्रतिक्रिया टाइम्स का विश्लेषण। मनोवैज्ञानिक अनुसंधान के अंतर्राष्ट्रीय जर्नल , 3 (2), 12–28।

मैं वास्तव में पूरी तरह से उनकी किताब को पसंद करता था, जिसमें मिश्रित मॉडल पर एक अच्छा परिचयात्मक अध्याय भी है (और एक आँकड़े पुस्तक के लिए बहुत सस्ता है):
बेयेन, आरएच (2008)। भाषाई डेटा का विश्लेषण: आर का उपयोग करके आँकड़ों का एक व्यावहारिक परिचय । कैम्ब्रिज, यूके; न्यूयॉर्क: कैम्ब्रिज यूनिवर्सिटी प्रेस।

मुझे शायद लगता है कि उसके पास भी बहुत सारे कागज़ात हैं lme4, लेकिन जैसा कि मेरी मुख्य दिलचस्पी मनोचिकित्सा नहीं है, आप उसके मुखपृष्ठ की जांच कर सकते हैं ।

अपने क्षेत्र (तर्क) से, मुझे इस एक पेपर का पता है जो उपयोग करता है lme4:

फुगार्ड, एजेबी, फेफर, एन।, मेयरहोफर, बी।, और क्लेटर, जीडी (2011)। लोग सशर्त की व्याख्या कैसे करते हैं: सशर्त घटना की ओर बढ़ता है। प्रायोगिक मनोविज्ञान जर्नल: सीखना, स्मृति और अनुभूति , 37 (3), 635-648। डोई: 10.1037 / a0022329

(हालांकि, मुझे लगता है कि वे मॉडल की तुलना करने के लिए एक संभावना अनुपात परीक्षण का उपयोग करते हैं जो केवल निश्चित मापदंडों में भिन्न होते हैं, जो मैंने सुना है वह सही तरीका नहीं है। मुझे लगता है कि आपको इसके बजाय एआईसी का उपयोग करना चाहिए।)


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भाषाई डेटा का विश्लेषण करने का मसौदा : आर का उपयोग करके आंकड़ों का एक व्यावहारिक परिचय यहां उपलब्ध है
MYaseen208

मेरे पास पीडीएफ भी था, लेकिन जैसा कि पुस्तक वास्तव में सस्ती थी मैंने इसे खरीदा और वास्तव में खुश हूं। यदि आपके पास पुस्तक के रूप में है तो यह पढ़ना आसान है।
हेनरिक

@ हेनरिक का कहना है कि एलआरटी का उपयोग उन मॉडलों की तुलना करने के लिए नहीं किया जाना चाहिए जो केवल निश्चित प्रभावों में भिन्न हैं, क्या आपके पास इसके लिए कोई संदर्भ है?
मैट

@ मैट मुझे ezपैकेज से माइक लॉरेंस के साथ एक चर्चा से यह जानकारी है : group.google.com/forum/# ​​.topic / ez4r / GQTEtNziRwE माइक इसके लिए पिनहेइरो और बेट्स (2000) का हवाला देते हैं, लिंक देखें।
हेनरिक

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यह पारिस्थितिकी और विकास के लिए मिश्रित मॉडल पर एक अत्यधिक उद्धृत पेपर है:


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निम्नलिखित लेख सामाजिक विज्ञान सेटिंग्स में बहुस्तरीय मॉडलिंग के उपयोग को बढ़ावा देने का प्रयास करता है:

  • ब्लिसे, पीडी और प्लोरहार्ट, आरई (2002)। ग्रोथ मॉडलिंग रैंडम गुणांक मॉडल का उपयोग करना: मॉडल बिल्डिंग, परीक्षण, और चित्र, संगठनात्मक अनुसंधान के तरीके, वॉल्यूम। 5 नंबर 4, अक्टूबर 2002 362-387। पीडीएफ

सार उद्धृत करने के लिए:

इस लेख में, लेखक बताते हैं कि अनुदैर्ध्य डेटा के विश्लेषण के लिए विकास मॉडल विकसित करने के लिए यादृच्छिक गुणांक मॉडलिंग का उपयोग कैसे किया जा सकता है। यादृच्छिक गुणांक मॉडल की पिछली चर्चाओं के विपरीत, यह लेख एक मॉडल तुलना ढांचे का उपयोग करके चरण-दर-चरण मार्गदर्शन प्रदान करता है। इस तरह मॉडलिंग से संपर्क करके, लेखक एक प्रतिगमन नींव बनाने और उत्तरोत्तर अधिक जटिल मॉडल का अनुमान लगाने और मूल्यांकन करने में सक्षम हैं। मॉडल तुलना फ्रेमवर्क में, लेख वैकल्पिक मॉडल के विपरीत (व्यक्तिगत मापदंडों से जुड़े महत्व के परीक्षणों पर विशिष्ट निर्भरता के बजाय) संभावना के परीक्षणों का उपयोग करने के मूल्य को दिखाता है, और यह ओपन-सोर्स भाषा आर में कोड प्रदान करता है जिससे पाठकों को दोहराने की अनुमति मिल सके परिणाम।

इस पत्र का हवाला देते हुए Google विद्वान पर सूचीबद्ध लेखों की एक परीक्षा में कई अन्य उपयोगी सुराग दिए गए हैं


यह पेपर वाकई दिलचस्प लगता है। दुर्भाग्य से यह केवल के बजाय lmeसे उपयोग करता है । (+1)nlmelmerlme4
हेनरिक

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मैं ज़्यूर, एएफ, इनेनो, एन, वॉकर, एन।, सेवेलिव, एए, और स्मिथ, जीएम (2009) पढ़ रहा हूं। आर के साथ पारिस्थितिकी में मिश्रित प्रभाव मॉडल और एक्सटेंशन । न्यूयॉर्क, एनवाई: स्प्रिंगर साइंस + बिजनेस मीडिया, एलएलसी। यह पारिस्थितिकविदों के लिए लिखा गया है, इसलिए आँकड़ों का पालन करना काफी आसान है; मुझे लगता है कि यह अन्य विषयों के लोगों के लिए उपयोगी होगा, जैसे कि दवा या मनोविज्ञान भी। कई केस स्टडी शामिल हैं, और प्रत्येक में एक विस्तृत अनुभाग है कि कैसे एक पेपर में आँकड़ों को सबसे अच्छा लिखा जाए।


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पारिस्थितिकी में मिश्रित मॉडल का उपयोग करने का एक उत्कृष्ट उदाहरण है:

दुर्भाग्य से यह पुराने आर पुस्तकालयों का उपयोग करता है।

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