एक सामान्य रेखीय मॉडल, जैसे कि पॉइसन मिश्रित मॉडल (चमक के साथ फिट) के लिए लाइसेन्स क्या रिपोर्ट करता है?


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मैं एक डिज़ाइन किए गए प्रयोग से आँख-ट्रैकिंग डेटा का विश्लेषण कर रहा हूं। मेरे डेटा का एक सरलीकृत संस्करण इस तरह दिखता है (आप यहाँ dput () डेटा प्राप्त कर सकते हैं ),

head(lookDATA)

  participant fixationImage fixationCount
1           9    Automobile            81
2           9          Bird            63
3           9         Chair            82
4           9           Dog            64
5           9          Face            90
6           9         Plant            75

जहां प्रतिभागी प्रत्येक विषय के लिए एक विशिष्ट पहचानकर्ता है, फिक्सेशनइमेज वह चित्र श्रेणी है जिसे उन्होंने ठीक किया है, और निर्धारण उस समय है जब उन्होंने उस चित्र श्रेणी पर निर्धारण किया है।

मैं lme4 पैकेज से ग्लेमर () का उपयोग करके डेटा के लिए एक पॉइसन मॉडल फिट करता हूं

model<-glmer(fixationCount ~ fixationImage + (1|participant), family = poisson, data = lookDATA)

मैंने कारक स्तरों के बीच अंतर की जांच करने के लिए lsmeans पैकेज से lsmeans () का उपयोग किया ,

cld(lsmeans(model,"fixationImage"))

जो निम्न आउटपुट प्रदान करता है:

fixationImage   lsmean         SE df asymp.LCL asymp.UCL .group
Chair         3.786022 0.05764923 NA  3.673018  3.899026  1    
Bird          3.866201 0.05750641 NA  3.753476  3.978925   2   
Dog           3.868768 0.05751010 NA  3.756037  3.981500   2   
Body          3.883644 0.06040952 NA  3.765230  4.002059   23  
Plant         3.893327 0.05746744 NA  3.780679  4.005975   23  
Automobile    3.901939 0.05745528 NA  3.789315  4.014563   23  
Face          3.946848 0.05832549 NA  3.832519  4.061178    3 

मेरे (शायद सीमित) समझ के अनुसार उपयोग करने वाले लोगों के बारे में समझने के लिए मॉडल के द्वारा भविष्यवाणी की गई श्रेणी के लिए लगने वाले कॉलम की औसत संख्या का प्रतिनिधित्व करना चाहिए।

हालाँकि, ये मान इन नंबरों के लिए सरल वर्णनात्मक आंकड़ों से बहुत दूर लगते हैं,

summaryBy(fixationCount ~ fixationImage, data = lookDATA)

  fixationImage fixationCount.mean
1    Automobile           55.18750
2          Bird           53.25000
3          Body           57.12821
4         Chair           50.39450
5           Dog           53.82883
6          Face           56.76389
7         Plant           54.71429

शायद यह सुझाव देते हुए कि मुझे यह ठीक से समझ में नहीं आ रहा है कि यहाँ के लोग क्या दर्शाते हैं, या शायद यह कि मैंने मॉडल को गलत बना दिया है।

किसी भी सहायता की काफी सराहना की जाएगी।

जवाबों:


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आउटपुट प्रत्येक छवि के लिए आपके मॉडल से भविष्यवाणियों का प्रतिनिधित्व करता है। जहर परिवार के साथ, डिफ़ॉल्ट लिंक फ़ंक्शन प्राकृतिक लॉग है - इसलिए वे मान लॉग स्केल पर हैं। यदि आप करते हैं lsmeans(..., type = "response"), तो यह भविष्यवाणियों को मूल प्रतिक्रिया पैमाने पर वापस बदल देगा।


इतना तेजी से जवाब के लिए धन्यवाद। मैंने अपने सिंटैक्स को cld (lsmeans (मॉडल, "fixationImage", type = "response")) में बदल दिया है, लेकिन निम्नलिखित त्रुटि मिली: त्रुटि $<-.data.frame( *tmp*, "sep", value = ","): प्रतिस्थापन में 1 पंक्ति, डेटा है 0. मैं रिकॉर्ड के लिए आर संस्करण 3.1.2 (2014-10-31) 'कद्दू हेलमेट' और 2.17 संस्करण का उपयोग कर रहा हूं। फिर भी, आपने मेरे प्रश्न का उत्तर दिया है और मैं आउटपुट को मैन्युअल रूप से बदलूंगा। एक बार फिर धन्यवाद!
मार्कस मॉरिसिन

अद्यतन: त्रुटि आर संस्करण 3.2.0 (2015-04-16), "सामग्री से भरा हुआ" के अपडेट पर कायम रही
मार्कस मॉरिसिज

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मुझे यकीन नहीं है कि त्रुटि क्यों होती है, लेकिन ऐसा लगता है कि यह cldचीजों के पक्ष से आता है । इसे बाहर निकालें और देखें कि क्या यह काम करता है। और pairsतुलना (एक अलग कॉल में) का परीक्षण करने के लिए cld के बजाय का उपयोग करें। वैसे भी यह एक बेहतर मार्ग है क्योंकि cld श्वेत-श्याम निर्णय लेता है।
अगस्त को रोस लेन्थ

एक बार फिर धन्यवाद। आप सही थे, cld के बाहर ठीक कार्य ()। मैं जोड़े की श्रेष्ठता () के बारे में आपके आकलन से सहमत हूं। मैं साजिश रचने के लिए cld () आउटपुट का उपयोग करने की योजना बनाता हूं और पूरक सामग्री में जोड़े () से अधिक विस्तृत जानकारी के साथ एक तालिका शामिल करता हूं। बहुत बढ़िया पैकेज, बढ़िया काम जारी रखें।
मार्कस मॉरिसिए

3
@MarcusMorrisey मैंने cldउस त्रुटि को बग बनाया है। इसे रिपोर्ट करने के लिए धन्यवाद। यदि आप मुझे अद्यतन पैकेज भेजना चाहते हैं, तो मुझे एक ई-मेल (मेंटेनर फ़ील्ड देखें) भेजें। कुछ हफ्तों में इसे CRAN पर अपडेट कर दिया जाएगा।
रस्स लेन्थ
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