मेटा-पैकेज का उपयोग करके आर में मेटा-विश्लेषण


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एक छोटे मेटा-विश्लेषण के निम्नलिखित वास्तविक जीवन के उदाहरण में परिणाम प्राप्त करने के लिए मुझे मेटाफ़र पैकेज rmaसे फ़ंक्शन को कैसे सिंटैक्स करना चाहिए ? (यादृच्छिक-प्रभाव, सारांश सांख्यिकीय SMD)

study,      mean1, sd1,    n1,  mean2,  sd2,   n2

Foo2000,    0.78,  0.05,   20,  0.82,   0.07,  25    
Sun2003,    0.74,  0.08,   30,  0.72,   0.05,  19    
Pric2005,   0.75,  0.12,   20,  0.74,   0.09,  29    
Rota2008,   0.62,  0.05,   24,  0.66,   0.03,  24    
Pete2008,   0.68,  0.03,   10,  0.68,   0.02,  10

जवाबों:


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एक उचित बनाएँ data.frame:

df <- structure(list(study = structure(c(1L, 5L, 3L, 4L, 2L), .Label = c("Foo2000", 
"Pete2008", "Pric2005", "Rota2008", "Sun2003"), class = "factor"), 
    mean1 = c(0.78, 0.74, 0.75, 0.62, 0.68), sd1 = c(0.05, 0.08, 
    0.12, 0.05, 0.03), n1 = c(20L, 30L, 20L, 24L, 10L), mean2 = c(0.82, 
    0.72, 0.74, 0.66, 0.68), sd2 = c(0.07, 0.05, 0.09, 0.03, 
    0.02), n2 = c(25L, 19L, 29L, 24L, 10L)), .Names = c("study", 
"mean1", "sd1", "n1", "mean2", "sd2", "n2"), class = "data.frame", row.names = c(NA, 
-5L))

भागो rma-फंक्शन:

library(metafor)
rma(measure = "SMD", m1i = mean1, m2i = mean2, 
    sd1i = sd1, sd2i = sd2, n1i = n1, n2i = n2, 
    method = "REML", data = df)

कृपया ध्यान रखें कि rmaमानता है (m1i-m2i)। इसका परिणाम निम्न यूनीवेट यादृच्छिक प्रभाव मॉडल मेटा-विश्लेषण में है:

> rma(measure = "SMD", m1i = mean1, m2i = mean2, 
+     sd1i = sd1, sd2i = sd2, n1i = n1, n2i = n2, 
+     method = "REML", data = df)

Random-Effects Model (k = 5; tau^2 estimator: REML)

tau^2 (estimate of total amount of heterogeneity): 0.1951 (SE = 0.2127)
tau (sqrt of the estimate of total heterogeneity): 0.4416
I^2 (% of total variability due to heterogeneity): 65.61%
H^2 (total variability / within-study variance):   2.91

Test for Heterogeneity: 
Q(df = 4) = 11.8763, p-val = 0.0183

Model Results:

estimate       se     zval     pval    ci.lb    ci.ub          
 -0.2513   0.2456  -1.0233   0.3061  -0.7326   0.2300          

---
Signif. codes:  0 ‘***’ 0.001 ‘**’ 0.01 ‘*’ 0.05 ‘.’ 0.1   1 

आप अनुमान बदलना चाह सकते हैं method, उदाहरण के लिए method = "DL"(लेकिन मैं साथ रहना REML)।

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