मैं हर तीसरे चरित्र के बाद एक चरित्र जोड़ने के लिए एक सेड वन लाइनर कैसे लिखूं?

Question

तो, मेरे पास एक स्ट्रिंग है जो इस तरह दिखता है:

AUGGCCAUGGCGCCCAGAACUGAGAUCAAUAGUACCCGUAUUAACGGGUGA

और मैं '+' चिह्न द्वारा सीमांकित स्ट्रिंग को 3-वर्णों में विभाजित करना चाहता हूं।

AUG+GCC+AUG+GCG+CCC+AGA+ACU+GAG+AUC+AAU+AGU+ACC+CGU+AUU+AAC+GGG+UGA

और मैं अपने अच्छे दोस्त के साथ ऐसा करना चाहता हूं sed।

मैंने कोशिश की

cat codons | sed -r 's/([A-Z]\{3\})/\1\+/g'

... कोई सफलता नहीं के साथ।

मैं किस sedकमांड का उपयोग कर सकता हूं?

Comments

क्या यह किसी तरह से रोजालिंड से जुड़ा नहीं है ? बस उत्सुक।

— m0nhawk

Answer 1

चूंकि आप एक अनुगामी नहीं चाहते हैं +, आप ऐसा कर सकते हैं:

fold -w3 | paste -sd+ -

यही है, चरित्र मूर्ति foldपर पंक्तियाँ , और उन 3 वर्ण रेखाएं उनके साथ समाप्त होती हैं जो कि अमृत ​​के रूप में होती हैं जो वास्तव में हर नई रेखा के चरित्र को बदलने की तरह है लेकिन अंतिम एक में । यदि इनपुट में एक से अधिक लाइन थी, तो आप उन लाइनों के साथ समाप्त हो जाएंगे, जो आप चाहते हैं या नहीं हो सकता है।3wpastes+d++

यदि आपको इसकी आवश्यकता है sed, तो आप इसके +बाद की ट्रेलिंग को हटा सकते हैं :

sed 's/.../&+/g;s/+$//'

Comments

क्या आप समझेंगे कि यह कैसे काम करता है?

— एनएन

@ एनएन यह काम करता है क्योंकि +$एक पंक्ति के अंत से तुरंत पहले एक प्लस प्रतीक से मेल खाता है।

— क्रिस डाउन

fold -w3स्ट्रिंग को 3 वर्ण रेखाओं में विभाजित करता है। paste -sd+ -में newlines बदल जाता है +।

— bahamat

Answer 2

sed 's/.../&+/g'

अपने तरीके से काम करने के लिए आपको {}प्रतीकों से बचने की आवश्यकता नहीं है :

sed -r 's/([A-Z]{3})/\1+/g'

Comments

कौन जानता था! मैं अब तक बहुत करीब था ... धन्यवाद ...

— ixtmixilix

दोनों एक अनुगामी '+' जोड़ते हैं। क्या यह इरादा है?

— एनएन

Answer 3

यह आपके लिए काम कर सकता है (GNU sed):

sed 's/...\B/&+/g' file

Answer 4

अगर sed नहीं है तो रूबी का उपयोग करना एक विकल्प नहीं हो सकता है। रूबी दुभाषिया, को rubyसीड की तरह इस्तेमाल किया जा सकता है और इसे -nविकल्प के साथ चलाकर जगाया जा सकता है, जो इसके इनपुट पर पुनरावृति करता है। दुभाषिया को तब -eविकल्प के तर्क के रूप में जोड़कर रूबी एक-लाइनर के साथ खिलाया जा सकता है (जो दुभाषिया को -eकिसी फ़ाइल में स्क्रिप्ट की तलाश करने के बजाय तर्क की व्याख्या करने के लिए कहता है )।

इस विशेष समस्या के लिए आप निम्नलिखित एक-लाइनर ( https://stackoverflow.com/a/3184271/7/7593 से अनुकूलित) का उपयोग कर सकते हैं ) का :

ruby -ne 'puts $_.scan(/.{3}|.+/).join("+")'

सादे भाषा में इसे

• किसी भी 3 वर्ण या कम से कम एक वर्ण से मेल खाता है, scan(/.{3}|.+/) इनपुट स्ट्रिंग में, $_(इस मामले में इनपुट मानक से आने की उम्मीद है) और प्रत्येक मैच को एक सरणी में रखता है;
• सरणी को प्रत्येक तत्व से जोड़ने वाले '+' के साथ एक स्ट्रिंग में जोड़ता है join("+"),
• और प्रिंट यह एक नई पंक्ति द्वारा समाप्त puts।

उदाहरण के लिए

echo "AUGGCCAUGGCGCCCAGAACUGAGAUCAAUAGUACCCGUAUUAACGGGUG" | ruby -ne 'puts $_.scan(/.{3}|.+/).join("+")'
AUG+GCC+AUG+GCG+CCC+AGA+ACU+GAG+AUC+AAU+AGU+ACC+CGU+AUU+AAC+GGG+UG

ध्यान दें कि इसमें कोई अनुगामी '+' नहीं जोड़ा गया है।