मैं मान रहा हूं कि आपके पास wubi.exe इंस्टॉलर है क्योंकि यह कैसे काम करता है। Wubi.exe इंस्टॉलर का उपयोग करके उबंटू को विंडोज़ पर एक एप्लिकेशन के रूप में स्थापित किया जाएगा। यह एक दोहरी बूटिंग प्रणाली की तरह दिखाई देगा (यहां तक कि आपके बूटलोडर में एक उबंटू विकल्प है) लेकिन यह अपने स्वयं के विभाजन या किसी भी चीज पर नहीं होगा, यह बस उस विंडोज निर्देशिका में संग्रहीत किया जाएगा जिसे आपने इसे स्थापित किया था। आप जो चाहते हैं वह अपने स्वयं के ड्राइव पर एक वास्तविक स्थापना है।
अपने स्वयं के ड्राइव पर Ubuntu स्थापित करने के लिए आपको एक ubuntu iso फ़ाइल की आवश्यकता होगी। वे Ubuntu डाउनलोड पृष्ठ से हैं, संस्करण 12.04 या 13.10 चुनें, इससे कोई फर्क नहीं पड़ता। आपको बूट करने योग्य usb कुंजी या iso फ़ाइल से CD बनाने के लिए pendrive Linux या इसी तरह के कार्यक्रम की आवश्यकता होगी । ड्राइव का चयन करते समय बहुत सावधानी से चरणों का पालन करना सुनिश्चित करें क्योंकि पेन ड्राइव लिनक्स आपके सिस्टम को तोड़ सकता है। एक बार जब आपके पास बूट करने योग्य यूएसबी या सीडी है, तो अपने पीसी को प्लग इन करें और यूएसबी को बूट करें।
यूएसबी से बूट कैसे करें यह आपके सिस्टम पर निर्भर करता है; कुछ स्वचालित रूप से ऐसा करेंगे, कुछ को आपको मैन्युअल रूप से बूट मेनू में प्रवेश करना होगा और उसका चयन करना होगा। एक बार, आप अपनी भाषा और कुछ अन्य सेटिंग्स चुन लेंगे। आखिरकार आपको एक मेनू मिलेगा जहां आप अपने इंस्टॉलेशन प्रकार को चुन सकते हैं। आप शायद "समथिंग एल्स" विकल्प चुनना चाहते हैं, इससे आप खाली बाहरी ड्राइव को इंस्टॉल लोकेशन के रूप में चुन सकेंगे। यदि चित्र चीजों को स्पष्ट करते हैं तो इस गाइड को आपकी मदद करनी चाहिए।
उबंटू स्थापित होने के बाद, आपको कुछ BIOS प्रविष्टियों को बदलने की आवश्यकता हो सकती है। विशेष रूप से, अगर उबंटू एक बूट करने योग्य विकल्प नहीं है, तो इसे स्थापित करने के बाद आपको यह सुनिश्चित करने की आवश्यकता होगी कि आपकी सेटिंग्स बाहरी एचडीडी से बूटिंग की अनुमति दें।
नोट: मैंने कुछ खोज की है और इस सवाल को पाया जो आपके लिए बहुत समान लगता है। Izx का उत्तर बहुत विस्तृत है और बताता है कि दो अलग-अलग ड्राइव पर विंडोज एक्सपी और उबंटू को कैसे स्थापित किया जाए और अभी भी दोनों को बूट मेनू में दिखाई दे। यदि उसका उत्तर आपके लिए काम करता है तो आप उसे अंगूठा लगाना और उसे श्रेय देना न भूलें।