डीएनए अनुक्रमक के साथ समस्या


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मैंने हाल ही में मिनियन यूएसबी जीनोम (डीएनए) सीक्वेंसर प्राप्त किया है, जो उबंटू में ठीक से काम नहीं करता है।

मैं Ubuntu के 12.04 रिलीज का उपयोग कर रहा हूं। सीक्वेंसर को स्क्रिप्ट / ड्राइवर द्वारा ठीक से पता लगाया जाता है जो इसके साथ आता है, लेकिन लगता है कि नमूने का पता लगाने में असमर्थ है।

मैं प्रक्रिया का स्क्रीनशॉट संलग्न कर रहा हूं। किसी भी तरह की सहायता का स्वागत किया जाएगा!

यहाँ छवि विवरण दर्ज करें


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स्क्रिप्ट / सैंपल gksu
कलेक्टिंग

क्या डिवाइस कुछ उपयोगी संदेशों को / var / log / syslog या कुछ और पर फेंक देता है?
क्रिश्चियन

जवाबों:


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उपकरण को स्क्रिप्ट द्वारा ठीक से पहचाने जाने के बाद, यह अधिक संभावना है कि आपकी समस्या उबंटू मुद्दे के बजाय चीजों के जीन अनुक्रमक पक्ष पर है। क्या कोई अन्य उपयोगिताओं हैं जो आपको किसी अन्य सुविधाओं के लिए अपने अनुक्रमक के साथ संवाद करने की अनुमति देगा, शायद एक अंशांकन दिनचर्या? यदि उबंटू मशीन के साथ संवाद कर सकता है और इसे अन्य चीजों को करने के लिए प्राप्त कर सकता है, तो मुझे उम्मीद है कि समस्या कंप्यूटर के बजाय जीन अनुक्रमक के साथ होगी। एक अन्य संभावित परीक्षण एक और ऑपरेटिंग सिस्टम का उपयोग करने की कोशिश करना है, अगर सॉफ्टवेयर उपलब्ध है। अंत में, सुनिश्चित करें कि आपके पास सीक्वेंसर का नवीनतम फर्मवेयर है, और जो सॉफ़्टवेयर आप कनेक्ट करने के लिए उपयोग कर रहे हैं वह अद्यतित है।


एक और बात है जिसके बारे में मैं अटकलें लगा रहा हूं, वह यह है कि इसे शेल से चलाना प्राथमिकता से सबसे अधिक नहीं दे सकता है। यह ऑक्सफोर्ड नैनोपोर सीक्वेंसर है जिसे ग्रिड पर अनुमति देने से पहले पूर्ण प्रमाणीकरण की आवश्यकता होती है। उसके पास नमूने को चलाने और उपयोग करने के लिए पर्याप्त जानकारी नहीं है - यही मैं सोचता हूं।
all4naija

यह एक स्व-निहित डीएनए सीक्वेंसर है। यह इंटरफ़ेस सबसे अधिक संभावना है कि एक सामान्य यूएसबी सीरियल पोर्ट एडाप्टर है जो प्रदान की गई स्क्रिप्ट बात कर रहा है - जो ठीक से काम कर रहा है। मैं मानता हूं कि समस्या शायद चीजों के अनुक्रम अंत के साथ है, न कि कंप्यूटर के साथ इंटरफेस। ग्रिड "क्लाउड कंप्यूटिंग" प्लेटफॉर्म नहीं है, यह बड़ी नौकरियों के लिए जीन सीक्वेंसर का एक समानांतर सरणी है।
एड्रियन

अधिक जानकारी के लिए: nanoporetech.com/technology/the-gridion-system/…
all4naija

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एक जंगली अनुमान: क्या यह एक अनुमति मुद्दा हो सकता है? कुछ उपकरण कुछ ऑपरेशनों के लिए ठीक काम करते हैं जब एक साधारण उपयोगकर्ता के रूप में चलते हैं, लेकिन rootअन्य संचालन करने के लिए विशेषाधिकारों की आवश्यकता होती है । इस प्रकार, आप कोशिश कर सकते हैं sudo ./gseqऔर देखें कि क्या मदद करता है। यदि वह मदद करता है लेकिन आप rootहर समय नहीं चलाना चाहते हैं , तो आप अपने सामान्य खाते का उपयोग करके अपने आप को डिवाइस तक पहुँच देने के लिए डिवाइस फ़ाइल (ओं) को ट्रैक कर सकते हैं और उनकी अनुमतियाँ बदल सकते हैं। इसमें शायद udv नियम बनाना शामिल होगा। मैं उस में यहाँ नहीं जाऊँगा क्योंकि यह समाधान एक लंबे शॉट का एक सा है।


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क्या यह संभव है कि डिवाइस का 6 घंटे का जीवन पार हो गया है? ऐसा लगता है कि यह एक उपकरण त्रुटि या एक प्रक्रिया समस्या का अधिक है। मिनियन तकनीकी समर्थन संभवतः इस मुद्दे को हल करने के लिए आपका मुख्य संपर्क होना चाहिए क्योंकि यह प्रकट होता है कि कार्यक्रम डिवाइस के साथ संचार कर रहा है।

क्रिस

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