एक शेंगेन वीजा पूरे क्षेत्र के लिए मान्य है। सिद्धांत रूप में, यदि आप एक शेंगेन देश से प्रतिबंधित हैं, तो आपको पूरे क्षेत्र से प्रतिबंधित किया जाना चाहिए, लेकिन वीजा से इनकार करना प्रतिबंध नहीं है। इसके विपरीत, स्विट्जरलैंड केवल स्विट्जरलैंड के लिए (कुछ विशिष्ट मामलों के बाहर) वैध वीजा नहीं दे सकता है, लेकिन यह तय करना चाहिए कि क्या आपको पूरे क्षेत्र में प्रवेश करने के लिए भरोसा किया जा सकता है। औपचारिक रूप से, स्विस वाणिज्य दूतावास के लिए एक आवेदन इसलिए जर्मन वाणिज्य दूतावास के लिए एक नए आवेदन से अलग नहीं है। प्रत्येक वाणिज्य दूतावास पिछले खाते को रद्द कर देगा और यह तय करना चाहिए कि समान नियमों के आधार पर वीजा देना है या नहीं।
लेकिन यह मत भूलो कि वीजा एक विशिष्ट यात्रा और उद्देश्य के लिए दिया जाता है। यदि आपने स्विट्जरलैंड में आवेदन किया है (और संभवतः एक यात्रा कार्यक्रम प्रस्तुत किया है, तो शायद एक निमंत्रण इत्यादि) और पूरी तरह से कहीं और दिखाया जाए, तो सीमा के गार्ड संदिग्ध हो सकते हैं। यदि आपने विशेष रूप से स्विस वाणिज्य दूतावास के लिए जर्मन वाणिज्य दूतावास के फैसले को दरकिनार करने के इरादे से आवेदन किया था, तो आपने धोखाधड़ी की होगी और आपके वीजा को रद्द कर दिया गया था (या इस बार भी उचित प्रतिबंध प्राप्त कर सकते हैं)।
और जर्मन बॉर्डर गार्ड निश्चित रूप से सभी की जांच करने के लिए सशक्त हैं, भले ही स्विट्जरलैंड ने आपका वीजा जारी किया हो। यदि आप किसी अन्य देश से वीजा के साथ कई बार वापसी के बाद दिखाते हैं, तो वे सामान्य से अधिक जिज्ञासु होने की संभावना है। इसलिए आपको सीमा पार करने के दौरान अपने यात्रा कार्यक्रम से चिपके रहने और सभी दस्तावेज (टिकट, बुकिंग, आमंत्रण, अपनी यात्रा के उद्देश्य, अपने रोजगार आदि) के बारे में विशेष रूप से सावधान रहने की आवश्यकता है।
दूसरी ओर, इस प्रक्रिया के बारे में कुछ भी स्वचालित नहीं है। यदि स्विट्जरलैंड वास्तव में आपका मुख्य गंतव्य है और आप केवल एक जर्मन हवाई अड्डे (इस प्रकार जर्मनी में प्रवेश करना चाहते हैं) पर पारगमन करना चाहते हैं, तो यह समस्या नहीं होनी चाहिए।