मैं PDB2PQR को कैसे स्थापित करूं जिससे APBS उपकरण PyMOL प्लगइन इसका उपयोग कर सके?


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PyMOL में APBS टूल ( http://www.pymolwiki.org/index.php/Apbsplugin ) नामक एक प्लगइन है जिसमें तीन अलग-अलग फ़ाइल इनपुट की आवश्यकता होती है:

  • APBS बाइनरी (apbs.exe)
  • APBS psize.py फ़ाइल
  • PDB2PQR pdb2pqr.py फ़ाइल

मैंने APBS स्थापित किया है और मेरी C: \ APBS निर्देशिका में apbs.exe और psize.py दोनों हैं। PDB2PQR समस्या है, मैंने http://sourceforge.net/projects/pdb2pqr/files/latest/download (64 बिट विंडोज के लिए संस्करण 2.0.0) डाउनलोड किया है और इसकी सामग्री निकाली है और निकाले गए किसी भी pdb2pqr.py फ़ाइल को खोजने में विफल रहा है। निर्देशिका। मैंने pdb2pqr 1.8.0 tarball (.tar.gz) को डाउनलोड करने और इसकी सामग्री निकालने की भी कोशिश की है, क्योंकि मुझे एक PyMOL उपयोगकर्ताओं की मेलिंग सूची पर सूचित किया गया था कि इसमें pdb2pqr.py फ़ाइल होनी चाहिए और PyMOL के साथ अधिक संगत हो सकती है। लेकिन यह टारबॉल स्रोत कोड है और इसे संकलित किया जाना चाहिए जो कि मेरी जानकारी के लिए विंडोज 7 पर संभव नहीं है।

जवाबों:


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http://www.poissonboltzmann.org/

यह आपके उत्तर का सबसे उपयोगी तरीका होगा कि आप उनके तकनीकी सहायता अनुभाग और सहायता से बातचीत करें। जैसा कि विंडोज 7 पर संकलन के लिए है, हाँ यह तब तक संभव है जब तक आपके पास कंप्लीट सोर्स कोड और संकलन रूटीन फ़ाइल है।

विंडोज 7 के कारण अहस्ताक्षरित ड्राइवरों को स्वीकार नहीं करने के कारण आपको सॉफ्टवेयर में विफलता का सामना करना पड़ सकता है, साथ ही आपकी निर्देशिका रूट निर्देशिका में स्थापित हो सकती है जो कि विन 7, 8 के रूप में एक बुरा विचार है और इसी तरह रूट निर्देशिका में विरासत प्रकार के इंस्टॉलेशन के लिए ब्लॉक हैं। ।

व्यक्तिगत रूप से मैं इंस्टॉलेशन में बदलाव करने पर ध्यान दूंगा और यह देखूंगा कि क्या आप इसे मुख्य प्रोग्राम फाइल्स डायरेक्टरी या प्रोग्राम फाइल्स x86 में इंस्टॉल करने के लिए प्राप्त कर सकते हैं यदि यह 32 बिट सॉफ्टवेयर है।

आपको इंस्टॉलेशन को ले जाने की अनुमति देने के लिए ड्राइव सुरक्षा सुविधाओं में संशोधन करना आवश्यक हो सकता है। आगे बढ़ने से पहले इस पर Microsoft नोट्स पढ़ें और संकलन करने से पहले किसी भी कोडिंग की जांच करें। यदि इसकी लिनक्स / यूनिक्स सर्वर आधारित प्रणाली एक आभासी उबंटू सर्वर दोहरी स्थापित आपके लिए कुछ काम की साबित हो सकती है।

यह सामान्य जानकारी है क्योंकि मुझे इस सवाल का उपयोग या फाइल सिस्टम का कोई ज्ञान नहीं है और इसे सलाह के रूप में लिया जाना चाहिए। यदि संदेह में निर्माता से बात करें और वहां मदद करें तो हमेशा कॉल का पहला पोर्ट होना चाहिए।

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