docker, अल्पाइन और matplotlib

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मैं वर्तमान में अल्पाइन का उपयोग करके हमारे डॉकटर छवियों में से एक को सिकोड़ने की कोशिश कर रहा हूं:

FROM python:2.7-alpine

हालाँकि, मुझे matplotlib.h स्थापित करने में परेशानी हो रही है:

EOF
warning: no previously-included files matching '*.pyo' found anywhere in distribution
warning: no previously-included files matching '*.pyd' found anywhere in distribution
numpy/core/src/multiarray/numpyos.c:18:21: fatal error: xlocale.h: No such file or directory
compilation terminated.
numpy/core/src/multiarray/numpyos.c:18:21: fatal error: xlocale.h: No such file or directory
compilation terminated.
Traceback (most recent call last):
  File "<string>", line 1, in <module>
  File "/tmp/pip-build-kCID_8/matplotlib/setup.py", line 383, in <module>
    **extra_args
  File "/usr/local/lib/python2.7/distutils/core.py", line 111, in setup
    _setup_distribution = dist = klass(attrs)
  File "/usr/local/lib/python2.7/site-packages/setuptools/dist.py", line 269, in __init__
    self.fetch_build_eggs(attrs['setup_requires'])
  File "/usr/local/lib/python2.7/site-packages/setuptools/dist.py", line 313, in fetch_build_eggs
    replace_conflicting=True,
  File "/usr/local/lib/python2.7/site-packages/pkg_resources/__init__.py", line 826, in resolve
    dist = best[req.key] = env.best_match(req, ws, installer)
  File "/usr/local/lib/python2.7/site-packages/pkg_resources/__init__.py", line 1071, in best_match
    return self.obtain(req, installer)
  File "/usr/local/lib/python2.7/site-packages/pkg_resources/__init__.py", line 1083, in obtain
    return installer(requirement)
  File "/usr/local/lib/python2.7/site-packages/setuptools/dist.py", line 380, in fetch_build_egg
    return cmd.easy_install(req)
  File "/usr/local/lib/python2.7/site-packages/setuptools/command/easy_install.py", line 640, in easy_install
    return self.install_item(spec, dist.location, tmpdir, deps)
  File "/usr/local/lib/python2.7/site-packages/setuptools/command/easy_install.py", line 670, in install_item
    dists = self.install_eggs(spec, download, tmpdir)
  File "/usr/local/lib/python2.7/site-packages/setuptools/command/easy_install.py", line 850, in install_eggs
    return self.build_and_install(setup_script, setup_base)
  File "/usr/local/lib/python2.7/site-packages/setuptools/command/easy_install.py", line 1078, in build_and_install
    self.run_setup(setup_script, setup_base, args)
  File "/usr/local/lib/python2.7/site-packages/setuptools/command/easy_install.py", line 1066, in run_setup
    raise DistutilsError("Setup script exited with %s" % (v.args[0],))
distutils.errors.DistutilsError: Setup script exited with error: Command "gcc -fno-strict-aliasing -g -O2 -DNDEBUG -g -fwrapv -O3 -Wall -Wstrict-prototypes -fPIC -DHAVE_NPY_CONFIG_H=1 -D_FILE_OFFSET_BITS=64 -D_LARGEFILE_SOURCE=1 -D_LARGEFILE64_SOURCE=1 -DHAVE_CBLAS -Ibuild/src.linux-x86_64-2.7/numpy/core/src/private -Inumpy/core/include -Ibuild/src.linux-x86_64-2.7/numpy/core/include/numpy -Inumpy/core/src/private -Inumpy/core/src -Inumpy/core -Inumpy/core/src/npymath -Inumpy/core/src/multiarray -Inumpy/core/src/umath -Inumpy/core/src/npysort -I/usr/local/include/python2.7 -Ibuild/src.linux-x86_64-2.7/numpy/core/src/private -Ibuild/src.linux-x86_64-2.7/numpy/core/src/private -Ibuild/src.linux-x86_64-2.7/numpy/core/src/private -c numpy/core/src/multiarray/numpyos.c -o build/temp.linux-x86_64-2.7/numpy/core/src/multiarray/numpyos.o" failed with exit status 1

मुझे एहसास है कि शायद इसकी वजह है musl।

यहाँ मेरे प्रासंगिक बिट्स हैं Dockerfile:

# xmlsec is only available in the testing repo
RUN apk add --no-cache --virtual .build-deps \
  xmlsec \
  xmlsec-dev \
  py-numpy \
  py-numpy-dev \
  --repository http://dl-3.alpinelinux.org/alpine/edge/testing/ \
  --allow-untrusted

RUN apk add --no-cache --virtual .build-deps \
  build-base \
  postgresql-dev \
  libffi-dev \
  nodejs \
  swig \
  git \
  libpng-dev \
  freetype-dev \
  libxml2-dev \
  libxslt-dev \
  python-dev \
  musl-dev \
  tk-dev \
  gfortran \
  py-setuptools \
  netcat-openbsd

RUN pip install -r requirements.txt

यह मेरी आवश्यकताएँ है।

setuptools==19.7
alabaster==0.7.4
amqp==1.4.6
anyjson==0.3.3
authy==2.1.2
awscli==1.9.12
Babel==1.3
backports.ssl-match-hostname==3.4.0.2
blessings==1.6
boto==2.9.9
certifi==2015.4.28
click==4.0
cryptography==1.0.1
Django==1.8.2
django-oauth-toolkit==0.8.1
django-appconf==1.0.1
django-compressor==1.5
django-cors-headers==1.1.0
django-coverage==1.2.4
django-crispy-forms==1.5.2
django-crontab==0.6.0
django-debug-panel==0.8.1
django-debug-toolbar==1.3.0
django-easy-pdf==0.1.0
django-email-extras==0.3.1
django-filter==0.10.0
django-forms-builder==0.11.1
django-libsass==0.3
django-markdown-deux==1.0.5
django-model-utils==2.2
django-nose==1.4
django-pgjson==0.3.1
django-phonenumber-field==0.7.2
django-pickling==0.1
django-ratelimit==0.6.0
django-redis==4.0.0
djangorestframework==3.3.1
djangorestframework-csv==1.3.4
django-rq==0.7.0
django-s3-cache==1.4.2
django-sphinx==2.2.4
django-storages==1.1.8
django-templatetag-handlebars==1.3.0
django-timedeltafield==0.7.10
django-twilio==0.8.0
docutils==0.12
ecdsa==0.11
extras==0.0.3
factory-boy==2.5.2
fake-factory==0.5.1
flex==4.3.0
functools32==3.2.3-1
gdata==2.0.18
gnureadline==6.3.3
greenlet==0.4.7
gunicorn==19.3.0
html5lib==0.999
httplib2==0.9.1
httpretty==0.8.10
inflection==0.3.1
ipdb==0.8
ipython==3.1.0
Jinja2==2.7.3
jsonschema==2.5.1
libsass==0.8.2
linecache2==1.0.0
lockfile==0.9.1
lxml==3.4.4
matplotlib==1.5.0
mimeparse==0.1.3
mistune==0.6
mock==1.3.0
newrelic==2.50.0.39
nose==1.3.6
nose-progressive==1.5.1
numpy==1.9.2
oauth2client==1.4.11
oauthlib==0.7.2
pandas==0.16.1
paramiko==1.15.2
pbr==1.0.1
pep8==1.6.2
phonenumbers==7.0.9
Pillow==2.8.1
pipdeptree==0.4.2
progressbar33==2.4
psycopg2==2.5.5
ptyprocess==0.5
pyasn1==0.1.7
pyasn1-modules==0.0.5
pycrypto==2.6.1
Pygments==2.0.2
PyJWT==1.3.0
pyOpenSSL==0.13
PyPDF2==1.24
python-daemon==1.6
python-dateutil==2.4.2
python-gnupg==0.3.7
python-logstash==0.4.6
python-memcached==1.54
python-mimeparse==0.1.4
python-openid==2.2.5
python-saml==2.1.3
python-social-auth==0.2.12
pytz==2015.4
PyYAML==3.11
pyzmq==14.6.0
raven==5.5.0
redis==2.10.3
reportlab==3.1.44
requests==2.7.0
requests-oauthlib==0.5.0
rq==0.5.2
rq-scheduler==0.5.1
rsa==3.1.4
simplejson==3.7.2
six==1.10.0
soaplib==2.0.0-beta2
sorl-thumbnail==12.2
Sphinx==1.3.1
sphinx-me==0.3
sqlparse==0.1.15
ssh==1.8.0
stripe==1.27.1
suds==0.4
terminado==0.5
testtools==1.8.0
traceback2==1.4.0
Unidecode==0.4.17
unittest2==1.0.1
uritemplate==0.6
vobject==0.6.6
Werkzeug==0.9.6
whitenoise==1.0.6
xhtml2pdf==0.0.6
django-absoluteuri==1.1.0

इसे स्थापित करने के लिए मुझे क्या करने की आवश्यकता है?

python  docker 
— सिनिक
स्रोत

जवाबों:

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मैंने इस समस्या को जोड़कर हल किया:

RUN ln -s /usr/include/locale.h /usr/include/xlocale.h

सब कुछ ठीक से स्थापित हो सकता है। लेकिन मुझे यकीन नहीं है कि यह अच्छा अभ्यास है।

— सेलीन ऑसॉरड
स्रोत
मैं समझता हूं कि आप कहां से आ रहे हैं - लेकिन मुझे लगता है कि अपने डॉकरफाइल में इसे कोड करने में सक्षम होना बेहतर है (एक टिप्पणी में इस सटीक पोस्ट के लिए एक उपयुक्त लिंक के साथ)। इस तरह की चीजों की वजह से डॉकटर अपने आलोचकों के बावजूद बहुत प्रभावशाली हैं।
— lol
यह Cygwin के लिए भी काम करता है। Numpy बस उपलब्ध होने पर xlocale.h को लोड करने की कोशिश करता है और किसी कारण से यह सोचता है कि यह सभी स्थानों के Cygwin में उपलब्ध है, लेकिन यह xlocale.h की विशेष क्षमता पर निर्भर नहीं करता है।
— CMCDragonkai
क्या प्रदान करता है /usr/include/locale.h? मैं एक अल्पाइन छवि का उपयोग कर रहा हूं और पहले से ही स्थापित कर रहा हूं, make python gcc libffi-dev linux-headers libgcc libstdc++लेकिन जरूरी फाइल पहली जगह पर लिंक करने के लिए नहीं है
— माइक
@ MichaelMügge यह musl-devपैकेज है
— सेलाइन ऑसॉरड
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आप शायद एक अल्पाइन लिनक्स डोकर छवि है कि का उपयोग करता है उपयोग करने की आवश्यकता glibcहै और की जगह musl-devके साथ glibc-headers, याद आ रही हेडर फाइल में इकट्ठा किए गए के बाद से glibc-headers।

डॉकर हब में सभी शीर्ष परिणाम जब आप glibcसक्षम अल्पाइन लाइनक्स डॉकटर छवियों को देखते हैं तो एपीके पैकेज के लिए एक ही स्रोत का उपयोग करते glibcहैं।

उस बिल्ड में हेडर शामिल नहीं है, लेकिन ऐसा करने के लिए इसे गायब फाइलों के साथ एक अन्य सबपेक को शामिल करके बनाया जा सकता है, (अप्राप्त) की तर्ज पर कुछ:

headers() {
  mkdir -p "$subpkgdir"/usr/glibc-compat
  cp -a "$srcdir"/usr/glibc-compat/include "$subpkgdir"/usr/glibc-compat
}

में APKBUILD फ़ाइल।

हालांकि, इस पर शोध करने के बाद, मैं आपके अंतिम कंटेनर में हेडर रखने की उपयोगिता पर सवाल उठाता हूं। मुझे ऐसा लगता है कि यह निर्भरता बनाने के लिए एक मध्यवर्ती कंटेनर होने के लिए बहुत अधिक उपयोगी होगा जो हेडर की आवश्यकता है, यदि संभव हो तो, और अपने कंटेनर में परिणामस्वरूप पैकेज स्थापित करें।

— Dawud
स्रोत
हम्म, यह मेरे लिए काम नहीं किया। मुझे इसके बारे में वही त्रुटि मिलती है xlocale.h। मैंने देखा कि यह musl-devवैसे भी स्थापित है, उन पैकेजों में से एक को इसकी आवश्यकता लगती है। libc-devभी स्थापित, जहाँ तक मैं बता सकता हूँ।
— पर्यायवाची
क्या आप अपने requirements.txt(या संबंधित हिस्से को उस निर्माण को ट्रिगर करता है जो वास्तव में आवश्यकता होती है matplotlib.h), स्थानीय स्तर पर पुन: पेश करने के लिए?
— दाऊद
ठीक है, मैंने इसे ओपी में जोड़ा
— 15
थोड़े शोध के बाद, काम के समाधान प्रदान करने के लिए एक गैर-तुच्छ राशि की आवश्यकता होती है, मैंने आवश्यकताओं को रेखांकित करने की कोशिश की है और हेडर फाइलें क्यों नहीं हैं। मैं इसे खाली जगह में भरने के लिए आपके पास छोड़ देता हूं। आशा है कि यह उपयोगी है, यद्यपि।
— 22
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ये निर्भरताएँ मेरे लिए काम करती हैं: docker run -c 'apk update && apk add g++ make subversion gcc gfortran ca-certificates python3-dev libpng-dev freetype-dev python3; ln -s /usr/include/locale.h /usr/include/xlocale.h; python3 -m pip install matplotlib'

बदलें python3के साथ pythonअगर आप 2.7 चाहते हैं

(@ सेलीन के जवाब के अलावा)

— ब्रायस गुंटा
स्रोत
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