मुझे नहीं लगता कि "प्रति फ़ोल्डर" एक सीमा है। यह NTFS वॉल्यूम प्रति फ़ाइलों की पूर्ण सीमा के समान होना चाहिए : 2 ^ 32 - 1 । इसके लिए 512 बाइट क्षेत्रों की आवश्यकता होगी और प्रति सेक्टर एक फ़ाइल की अधिकतम फ़ाइल आकार सीमा होगी।
वास्तविक रूप से आपको एक वास्तविक औसत फ़ाइल आकार की गणना करनी होगी और फिर इन सिद्धांतों को उस फ़ाइल आकार पर लागू करना होगा। इसलिए, मुझे पूर्वाग्रह नहीं होगा, मैंने 5000 से अधिक फ़ाइलों के साथ फ़ोल्डर देखा है। लेकिन अगर आप विंडोज एक्सप्लोरर में ऐसा फ़ोल्डर खोलना चाहते हैं, तो आपको मिनटों तक इंतजार करना पड़ सकता है। उस फ़ोल्डर तक पहुँचने के लिए कमांड लाइन टूल का उपयोग करने पर विचार करें।
यहां टेक्नेट पर एक दिलचस्प लिंक है: कैसे NTFS काम करता है