reproducibility पर टैग किए गए जवाब

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मैं यह कैसे सुनिश्चित करूं कि मेरे सिमुलेशन के परिणाम और मेरे पेपर के परिणाम हमेशा सिंक में हों?
अपने एक पेपर में, मैं कुछ आंकड़ों के अलावा कुछ संख्यात्मक परिणामों को सूचीबद्ध करता हूं। मैं जो करना चाहता हूं वह यह सुनिश्चित करना है कि मेरे पेपर में संख्यात्मक परिणाम हमेशा कोड के साथ सहमत हों। अभी, मैं सीधे अपने सिमुलेशन आउटपुट से संख्यात्मक परिणामों को पेपर में …

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अपने कम्प्यूटेशनल अनुसंधान को प्रतिलिपि प्रस्तुत करने योग्य बनाने के लिए मुझे एक पत्रिका लेख (या ऑनलाइन पोस्ट) के साथ क्या सामग्री शामिल करनी चाहिए?
कम्प्यूटेशनल साइंस रिसर्च में रिप्रोड्यूसबिलिटी अधिक से अधिक महत्वपूर्ण हो गई है। (उदाहरण के लिए, रोजर पेंग द्वारा इस लेख को विज्ञान में देखें ; मैं ऐसे अन्य लेखों और वेब साइटों से भी अवगत हूं।) हालांकि, यह मेरे लिए स्पष्ट नहीं है कि मुझे जर्नल लेख (या ऑनलाइन) बनाने …

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यदि आपको मालिकाना पुस्तकालयों की आवश्यकता है, तो प्रजनन योग्य अनुसंधान करने का सबसे अच्छा तरीका क्या है?
अभिकलन में पुनरुत्पादक अनुसंधान का उद्देश्य अन्य शोधकर्ताओं के लिए उपलब्ध कम्प्यूटेशनल पेपर में परिणाम उत्पन्न करने के लिए आवश्यक कोड बनाना है ताकि वे उस कोड को उस पेपर में परिणाम पुन: प्रस्तुत करने के लिए चला सकें। मैं अपने सभी अनुसंधानों को प्रतिलिपि प्रस्तुत करने योग्य बनाना चाहता …

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समानांतर कमी के लिए संख्यात्मक गैर-समरूपता को कैसे संबोधित किया जाए?
एक समानांतर कमी मानती है कि संबंधित ऑपरेशन सहयोगी है। फ्लोटिंग पॉइंट नंबरों के अलावा इस धारणा का उल्लंघन किया जाता है। आप पूछ सकते हैं कि मुझे इसकी परवाह क्यों है। खैर, यह परिणाम कम प्रजनन योग्य बनाता है। और यह तब और खराब हो जाता है जब नकली …

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अपने स्वयं के कोड का उपयोग करके अपने स्वयं के लेखों में प्रकाशित परिणामों को आसानी से कैसे पुन: प्रस्तुत करें
मैंने एक कार्यक्रम / पुस्तकालय लिखा था जिसका उपयोग मैं एक लेख में परिणाम प्राप्त करने के लिए करता था। (यहाँ यह है , लेकिन मेरा प्रश्न सामान्य है।) मेरे पास ऐसे परीक्षण हैं जो मैं नियमित रूप से चलाता हूं ctest(इसे चलाने में कुछ मिनट लगते हैं)। लेख में …

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एक पेपर के लिए कोड लिखने का सबसे उपयोगी तरीका क्या होगा ताकि पाठक उस कोड के परिणामों को स्पष्ट रूप से मेल कर सकें जो उन्हें उत्पन्न करता है?
मैं एक प्रतिलिपि प्रस्तुत करने योग्य कागज लिख रहा हूं, और कागज में कम्प्यूटेशनल परिणाम हैं जो एक पायथन स्क्रिप्ट (एक समान MATLAB स्क्रिप्ट लगभग समान परिणाम उत्पन्न करता है) द्वारा उत्पन्न होते हैं। मुझे लगता है कि पेपर को पाठकों के लिए समझना आसान होगा यदि वे कोड में …

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कम्प्यूटेशनल प्रयोगों के संचालन के लिए दिशानिर्देश क्या हैं?
भौतिकी, जीव विज्ञान, रसायन विज्ञान आदि में प्रयोग करने के लिए नियमों के अलग-अलग सेट हैं: क्या घटनाओं को प्रासंगिक माना जाता है, नमूनों के संदूषण से कैसे बचा जाए, एक प्रजनन प्रक्रिया कैसे बनाएं और ठीक करें आदि। संख्यात्मक प्रयोगों में सटीकता और reproducibility सुनिश्चित करने के लिए मानक, …

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यूनिट-टेस्टिंग फ्रेमवर्क के लिए कोई सिफारिश जो कोड / पुस्तकालयों के साथ संगत है जो एमपीआई का उपयोग करते हैं?
आमतौर पर, मैं सीरियल कोड लिखता हूं, और जब मैं करता हूं, तो मैं कुछ xUnit- शैली परीक्षण ढांचे (MATLAB xUnit, PyUnit / nose, या Google के C ++ परीक्षण ढांचे) के साथ इकाई परीक्षण लिखता हूं। एक सरसरी तौर पर Google खोज के आधार पर, मैंने यह नहीं देखा …

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कोड की अभिलेखीय दीर्घायु बढ़ाना
क्या कोड की दीर्घायु सुनिश्चित करने के लिए सर्वोत्तम प्रथाओं की एक प्रकाशित सूची है, जिसमें प्रजनन योग्य वैज्ञानिक परिणामों की ओर एक आँख है? (जैसे ओपन सोर्स, डॉक्यूमेंटेशन प्रैक्टिस, निर्भरता का चयन, भाषा का चयन, वर्चुअल मशीन, आदि)। किसी भी अध्ययन के बारे में जानें (या इसका अभाव है, …
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