मैं ग्रिड.आर्ग का उपयोग करके कितने मनमाने ढंग से ggplots की व्यवस्था कर सकता हूं?


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यह ggplot2 Google समूह पर क्रॉस-पोस्ट किया गया है

मेरी स्थिति यह है कि मैं एक ऐसे फ़ंक्शन पर काम कर रहा हूं जो एक अनियंत्रित संख्या में भूखंडों (उपयोगकर्ता द्वारा आपूर्ति किए गए इनपुट डेटा के आधार पर) को आउटपुट करता है। फ़ंक्शन n प्लॉट्स की एक सूची देता है, और मैं उन प्लॉटों को 2 x 2 गठन में रखना चाहता हूं। मैं एक साथ समस्याओं से जूझ रहा हूँ:

  1. मैं प्लॉट की मनमानी (एन) संख्या को लचीलेपन की अनुमति कैसे दे सकता हूं?
  2. मैं यह भी निर्दिष्ट कर सकता हूं कि मैं चाहता हूं कि उन्हें 2 x 2 निर्धारित किया जाए

मेरी वर्तमान रणनीति पैकेज grid.arrangeसे उपयोग करती gridExtraहै। यह शायद इष्टतम नहीं है, खासकर जब से, और यह महत्वपूर्ण है, यह पूरी तरह से काम नहीं करता है । यहाँ मेरा टिप्पणी नमूना कोड है, तीन भूखंडों के साथ प्रयोग:

library(ggplot2)
library(gridExtra)

x <- qplot(mpg, disp, data = mtcars)
y <- qplot(hp, wt, data = mtcars)
z <- qplot(qsec, wt, data = mtcars)

# A normal, plain-jane call to grid.arrange is fine for displaying all my plots
grid.arrange(x, y, z)

# But, for my purposes, I need a 2 x 2 layout. So the command below works acceptably.
grid.arrange(x, y, z, nrow = 2, ncol = 2)

# The problem is that the function I'm developing outputs a LIST of an arbitrary
# number plots, and I'd like to be able to plot every plot in the list on a 2 x 2
# laid-out page. I can at least plot a list of plots by constructing a do.call()
# expression, below. (Note: it totally even surprises me that this do.call expression
# DOES work. I'm astounded.)
plot.list <- list(x, y, z)
do.call(grid.arrange, plot.list)

# But now I need 2 x 2 pages. No problem, right? Since do.call() is taking a list of
# arguments, I'll just add my grid.layout arguments to the list. Since grid.arrange is
# supposed to pass layout arguments along to grid.layout anyway, this should work.
args.list <- c(plot.list, "nrow = 2", "ncol = 2")

# Except that the line below is going to fail, producing an "input must be grobs!"
# error
do.call(grid.arrange, args.list)

जैसा कि मैं करने के लिए अभ्यस्त हूं, मैं विनम्रतापूर्वक कोने में मंडराता हूं, बेसब्री से एक समुदाय की दूरगामी प्रतिक्रिया का बेसब्री से इंतजार कर रहा हूं। विशेष रूप से अगर मैं इसे बनाने की जरूरत से ज्यादा कठिन हूं।


2
एक बहुत अच्छी तरह से किया सवाल पर यश। मैं इसे एक अच्छा SO [r] प्रश्न लिखने के उदाहरण के रूप में उपयोग करने जा रहा हूं।
जेडी लॉन्ग

1
विशेष रूप से "विनम्रतापूर्वक huddling" भाग - एक अच्छा
कमर की

@ जेडी और @बेन - मैं चापलूसी कर रहा हूं, दोस्तों। निष्ठा से। और मैं वास्तव में मदद की सराहना करता हूं।
ब्रिंडक

जवाबों:


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तुम लगभग वहां थे! समस्या यह है कि do.callउम्मीद है कि आपका नाम एक listवस्तु में होगा। आपने उन्हें सूची में रखा है, लेकिन चरित्र स्ट्रिंग के रूप में, सूची आइटम का नाम नहीं।

मुझे लगता है कि यह काम करना चाहिए:

args.list <- c(plot.list, 2,2)
names(args.list) <- c("x", "y", "z", "nrow", "ncol")

जैसा कि बेन और जोशुआ ने टिप्पणियों में बताया था, जब मैंने सूची बनाई तो मैं नाम निर्दिष्ट कर सकता था:

args.list <- c(plot.list,list(nrow=2,ncol=2))

या

args.list <- list(x=x, y=y, z=x, nrow=2, ncol=2)

1
मैंने कई बार कोड बदला। संपादन के लिए क्षमा करें। क्या यह अब समझ में आता है? जब मैंने कहा कि वे पहले एक वेक्टर थे, तो मुझे याद आया। उसके लिए माफ़ करना।
जेडी लॉन्ग

2
आप सूची निर्माण के दौरान आर्ग्स का नाम दे सकते हैं:args.list <- list(x=x, y=y, z=x, nrow=2, ncol=2)
जोशुआ उलरिच

2
बिल्कुल नहीं। तुम्हारा उचित लंबाई का है। आपकी सूची की संरचना जेडी की सूची की संरचना से अलग है। Str () और नाम () का उपयोग करें। आपके सभी सूची तत्व अनाम हैं, इसलिए do.callसफल होने के लिए, सटीक स्थिति मिलान की आवश्यकता होगी।
IRTFM

2
@ जेडडी लॉन्ग; मैं दिल से मानता हूँ। और वेन अगर यह सभी त्रुटियों को नहीं रोकता है, तो आप अभी भी बहुत बेहतर त्रुटि संदेश और traceback()जानकारी प्राप्त करते हैं यदि आप नामित तर्क का उपयोग करते हैं।
IRTFM

1
मैं यहाँ चर्चा का पालन नहीं करता; पहला तर्क के बाद से grid.arrange()है ...स्थितीय मिलान शायद अप्रासंगिक है। प्रत्येक इनपुट या तो ग्रिड ऑब्जेक्ट (नाम के साथ या बिना), के लिए एक नामित पैरामीटर grid.layoutया शेष तर्कों के लिए एक नामित पैरामीटर होना चाहिए ।
बैपटिस्ट

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इसे इस्तेमाल करे,

require(ggplot2)
require(gridExtra)
plots <- lapply(1:11, function(.x) qplot(1:10,rnorm(10), main=paste("plot",.x)))

params <- list(nrow=2, ncol=2)

n <- with(params, nrow*ncol)
## add one page if division is not complete
pages <- length(plots) %/% n + as.logical(length(plots) %% n)

groups <- split(seq_along(plots), 
  gl(pages, n, length(plots)))

pl <-
  lapply(names(groups), function(g)
         {
           do.call(arrangeGrob, c(plots[groups[[g]]], params, 
                                  list(main=paste("page", g, "of", pages))))
         })

class(pl) <- c("arrangelist", "ggplot", class(pl))
print.arrangelist = function(x, ...) lapply(x, function(.x) {
  if(dev.interactive()) dev.new() else grid.newpage()
   grid.draw(.x)
   }, ...)

## interactive use; open new devices
pl

## non-interactive use, multipage pdf
ggsave("multipage.pdf", pl)

3
संस्करण> = gridExtra के 0.9 marrangeGrob सब स्वचालित रूप से ऐसा करने के लिए जब भी Nrow * ncol <लंबाई (भूखंडों) प्रदान करता है
बैप्टिस्ट

5
ggsave("multipage.pdf", do.call(marrangeGrob, c(plots, list(nrow=2, ncol=2))))
बपतिस्मा

4

मैं थोड़ा देर से जवाब दे रहा हूं, लेकिन आर ग्राफिक्स कुकबुक में एक समाधान पर ठोकर खाई है जो कि कस्टम फ़ंक्शन नामक एक बहुत ही समान कार्य करता है multiplot। शायद यह दूसरों को मदद करेगा जो इस प्रश्न को खोजते हैं। मैं उत्तर भी जोड़ रहा हूँ क्योंकि इस प्रश्न के अन्य उत्तरों की तुलना में समाधान नया हो सकता है।

एक पृष्ठ पर कई रेखांकन (ggplot2)

यहां वर्तमान फ़ंक्शन है, हालांकि कृपया उपरोक्त लिंक का उपयोग करें, जैसा कि लेखक ने उल्लेख किया है कि यह ggplot2 0.9.3 के लिए अपडेट किया गया है, जो इंगित करता है कि यह फिर से बदल सकता है।

# Multiple plot function
#
# ggplot objects can be passed in ..., or to plotlist (as a list of ggplot objects)
# - cols:   Number of columns in layout
# - layout: A matrix specifying the layout. If present, 'cols' is ignored.
#
# If the layout is something like matrix(c(1,2,3,3), nrow=2, byrow=TRUE),
# then plot 1 will go in the upper left, 2 will go in the upper right, and
# 3 will go all the way across the bottom.
#
multiplot <- function(..., plotlist=NULL, file, cols=1, layout=NULL) {
  require(grid)

  # Make a list from the ... arguments and plotlist
  plots <- c(list(...), plotlist)

  numPlots = length(plots)

  # If layout is NULL, then use 'cols' to determine layout
  if (is.null(layout)) {
    # Make the panel
    # ncol: Number of columns of plots
    # nrow: Number of rows needed, calculated from # of cols
    layout <- matrix(seq(1, cols * ceiling(numPlots/cols)),
                    ncol = cols, nrow = ceiling(numPlots/cols))
  }

 if (numPlots==1) {
    print(plots[[1]])

  } else {
    # Set up the page
    grid.newpage()
    pushViewport(viewport(layout = grid.layout(nrow(layout), ncol(layout))))

    # Make each plot, in the correct location
    for (i in 1:numPlots) {
      # Get the i,j matrix positions of the regions that contain this subplot
      matchidx <- as.data.frame(which(layout == i, arr.ind = TRUE))

      print(plots[[i]], vp = viewport(layout.pos.row = matchidx$row,
                                      layout.pos.col = matchidx$col))
    }
  }
}

एक प्लॉट ऑब्जेक्ट बनाता है:

p1 <- ggplot(...)
p2 <- ggplot(...)
# etc.

और फिर उन्हें पास करता है multiplot:

multiplot(p1, p2, ..., cols = n)
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