मैं 2 अलग-अलग y- कुल्हाड़ियों के साथ कैसे साजिश कर सकता हूं?

Question

मैं आर में दो तितर बितर भूखंडों को सुपरिमेंट करना चाहूंगा, ताकि अंकों के प्रत्येक सेट की अपनी (अलग) वाई-एक्सिस हो (यानी, आंकड़े पर 2 और 4 की स्थिति में), लेकिन अंक एक ही आंकड़े पर सुपरिम्प्ट दिखाई देते हैं।

क्या ऐसा करना संभव है plot?

समस्या दिखाते हुए उदाहरण कोड संपादित करें

# example code for SO question
y1 <- rnorm(10, 100, 20)
y2 <- rnorm(10, 1, 1)
x <- 1:10
# in this plot y2 is plotted on what is clearly an inappropriate scale
plot(y1 ~ x, ylim = c(-1, 150))
points(y2 ~ x, pch = 2)

Comments

कृपया नमूना डेटा प्रदान करें। यह आमतौर पर एक सौंदर्यवादी दृष्टिकोण से एक बुरा विचार है।

— चेस

के विशिष्ट मामले में जवाब और चर्चा ggplot2: stackoverflow.com/questions/3099219/… (एसओ के लिए खोज ) [r] two y-axesया [r] twoord.plot- कुछ अन्य संबंधित जवाब हैं, हालांकि (मेरे लिए यह आश्चर्य की बात है क्योंकि यह एक आर FAQ है) कुछ भी समान नहीं

— बेन बोल्कर

@ कोच - मैंने समस्या का एक कार्यशील उदाहरण जोड़ा। सौंदर्य के मुद्दों पर चेतावनी के लिए धन्यवाद।

— DQdlM

Answer 1

अद्यतन : कॉपी की गई सामग्री जो http://rwiki.sciviews.org/doku.php?id=tips:graphics-base:2yaxes पर आर विकी पर थी , लिंक अब टूटी हुई है: रास्ते से भी उपलब्ध मशीन

एक ही भूखंड पर दो अलग-अलग y कुल्हाड़ी

(कुछ सामग्री मूल रूप से डैनियल राजद 2006/03/31 15:26)

कृपया ध्यान दें कि बहुत कम परिस्थितियां हैं जहां एक ही भूखंड पर दो अलग-अलग पैमानों का उपयोग करना उचित है। ग्राफिक के दर्शक को गुमराह करना बहुत आसान है। निम्नलिखित दो उदाहरण और टिप्पणियों इस मुद्दे पर (चेक example1 , example2 से रद्दी चार्ट ), और साथ ही इस लेख स्टीफन कुछ (जो निष्कर्ष निकाला है "मैं निश्चित रूप, निष्कर्ष नहीं निकाल सकता एक बार और सभी के लिए, कि दोहरे बढ़ाया कुल्हाड़ियों साथ रेखांकन कभी नहीं कर रहे हैं उपयोगी, केवल यह कि मैं ऐसी स्थिति के बारे में नहीं सोच सकता जो उन्हें दूसरे, बेहतर समाधानों के प्रकाश में वारंट करता है। ") इसके अलावा इस बिंदु पर देखें # 4 बिंदु ...

आप निर्धारित कर रहे हैं, तो बुनियादी नुस्खा अपना पहला साजिश, सेट बनाने के लिए है par(new=TRUE)ग्राफिक्स उपकरण समाशोधन, के साथ दूसरे साजिश बनाने से रोकने के लिए आर axes=FALSE(और स्थापित करने xlabऔर ylab- खाली होने के लिए ann=FALSEऔर उसके बाद का उपयोग कर भी काम करना चाहिए) axis(side=4)एक नई धुरी जोड़ने के लिए दाईं ओर, और दाएँ हाथ की तरफ mtext(...,side=4)एक अक्ष लेबल जोड़ने के लिए। यहाँ एक उदाहरण है थोड़ा सा बना हुआ डेटा:

set.seed(101)
x <- 1:10
y <- rnorm(10)
## second data set on a very different scale
z <- runif(10, min=1000, max=10000) 
par(mar = c(5, 4, 4, 4) + 0.3)  # Leave space for z axis
plot(x, y) # first plot
par(new = TRUE)
plot(x, z, type = "l", axes = FALSE, bty = "n", xlab = "", ylab = "")
axis(side=4, at = pretty(range(z)))
mtext("z", side=4, line=3)

twoord.plot()में plotrixपैकेज इस प्रक्रिया को स्वचालित करता है, के रूप में doubleYScale()में latticeExtraपैकेज।

एक और उदाहरण (रॉबर्ट डब्ल्यू बेयर द्वारा एक आर मेलिंग सूची पोस्ट से अनुकूलित):

## set up some fake test data
time <- seq(0,72,12)
betagal.abs <- c(0.05,0.18,0.25,0.31,0.32,0.34,0.35)
cell.density <- c(0,1000,2000,3000,4000,5000,6000)

## add extra space to right margin of plot within frame
par(mar=c(5, 4, 4, 6) + 0.1)

## Plot first set of data and draw its axis
plot(time, betagal.abs, pch=16, axes=FALSE, ylim=c(0,1), xlab="", ylab="", 
   type="b",col="black", main="Mike's test data")
axis(2, ylim=c(0,1),col="black",las=1)  ## las=1 makes horizontal labels
mtext("Beta Gal Absorbance",side=2,line=2.5)
box()

## Allow a second plot on the same graph
par(new=TRUE)

## Plot the second plot and put axis scale on right
plot(time, cell.density, pch=15,  xlab="", ylab="", ylim=c(0,7000), 
    axes=FALSE, type="b", col="red")
## a little farther out (line=4) to make room for labels
mtext("Cell Density",side=4,col="red",line=4) 
axis(4, ylim=c(0,7000), col="red",col.axis="red",las=1)

## Draw the time axis
axis(1,pretty(range(time),10))
mtext("Time (Hours)",side=1,col="black",line=2.5)  

## Add Legend
legend("topleft",legend=c("Beta Gal","Cell Density"),
  text.col=c("black","red"),pch=c(16,15),col=c("black","red"))

इसी तरह के व्यंजनों का उपयोग विभिन्न प्रकारों - बार प्लॉट्स, हिस्टोग्राम, आदि के सुपरमोट प्लॉट्स के लिए किया जा सकता है।

Comments

यही कारण है कि लिंक-ओनली उत्तर एक बुरा विचार है ... wiki.r-project.org विरूपित प्रतीत होता है, मैं [e-mail] पर पूछ रहा हूं।

— बेन बोल्कर

@BenBolker आपका समाधान प्रतिभाशाली है! हालाँकि मेरा एक सवाल है यदि यह दोनों तरफ एक से अधिक पंक्ति में है, तो मैं अभी भी इस पद्धति का उपयोग करने में सक्षम हूं, लेकिन केवल प्रतीकों के साथ। जब मैं लाइन = प्लॉट का उपयोग करने की कोशिश करता हूं, तो यह उन्हें लगातार प्लॉट करने की कोशिश करता है। क्या आप इसे ठीक करने के लिए कोई चाल सुझाएंगे?

— wthimdh

@BenBolker क्या होगा यदि समय प्रकार का दिनांक प्रारूप है: "2019-01-01"। आप axis(1,pretty(range(time),10))लाइन कैसे बदलेंगे ?

— k.dkhk

Answer 2

जैसा कि इसके नाम, पता चलता है twoord.plot()में plotrix दो तालमेल की धुरी का पैकेज भूखंडों।

library(plotrix)
example(twoord.plot)

Comments

चालाक। उदाहरण के ट्रक लोड के लिए धन्यवाद। मैं उन रेखाओं और बार उदाहरणों में से एक को नकारात्मक मूल्यों के साथ देखना पसंद करूंगा। इसके अलावा स्टैकिंग अच्छा होगा।

— मैट बैनर्ट

Answer 3

एक विकल्प यह है कि दो भूखंडों को एक-दूसरे से अलग किया जाए। ggplot2इसके लिए एक अच्छा विकल्प प्रदान करता है facet_wrap():

dat <- data.frame(x = c(rnorm(100), rnorm(100, 10, 2))
  , y = c(rnorm(100), rlnorm(100, 9, 2))
  , index = rep(1:2, each = 100)
  )

require(ggplot2)
ggplot(dat, aes(x,y)) + 
geom_point() + 
facet_wrap(~ index, scales = "free_y")

Answer 4

यदि आप तराजू / अक्ष लेबल को छोड़ सकते हैं, तो आप डेटा को (0, 1) अंतराल पर पुनर्विक्रय कर सकते हैं। यह गुणसूत्रों पर अलग-अलग 'विगले' ट्रैक्स के लिए उदाहरण के लिए काम करता है, जब आप आमतौर पर पटरियों के बीच स्थानीय सहसंबंधों में रुचि रखते हैं और उनके पास अलग-अलग तराजू (हजारों, Fst 0-1) में कवरेज होता है।

# rescale numeric vector into (0, 1) interval
# clip everything outside the range 
rescale <- function(vec, lims=range(vec), clip=c(0, 1)) {
  # find the coeficients of transforming linear equation
  # that maps the lims range to (0, 1)
  slope <- (1 - 0) / (lims[2] - lims[1])
  intercept <- - slope * lims[1]

  xformed <- slope * vec + intercept

  # do the clipping
  xformed[xformed < 0] <- clip[1]
  xformed[xformed > 1] <- clip[2]

  xformed
}

फिर, के साथ एक डेटा फ्रेम होने chrom, position, coverageऔर fstस्तंभ, आप कुछ की तरह कर सकते हैं:

ggplot(d, aes(position)) + 
  geom_line(aes(y = rescale(fst))) + 
  geom_line(aes(y = rescale(coverage))) +
  facet_wrap(~chrom)

इसका लाभ यह है कि आप दो ट्रैकों तक सीमित नहीं हैं।

Answer 5

मैं भी पता चलता है, twoord.stackplot()में plotrixअधिक से दो तालमेल की धुरी का पैकेज भूखंडों।

data<-read.table(text=
"e0AL fxAL e0CO fxCO e0BR fxBR anos
 51.8  5.9 50.6  6.8 51.0  6.2 1955
 54.7  5.9 55.2  6.8 53.5  6.2 1960
 57.1  6.0 57.9  6.8 55.9  6.2 1965
 59.1  5.6 60.1  6.2 57.9  5.4 1970
 61.2  5.1 61.8  5.0 59.8  4.7 1975
 63.4  4.5 64.0  4.3 61.8  4.3 1980
 65.4  3.9 66.9  3.7 63.5  3.8 1985
 67.3  3.4 68.0  3.2 65.5  3.1 1990
 69.1  3.0 68.7  3.0 67.5  2.6 1995
 70.9  2.8 70.3  2.8 69.5  2.5 2000
 72.4  2.5 71.7  2.6 71.1  2.3 2005
 73.3  2.3 72.9  2.5 72.1  1.9 2010
 74.3  2.2 73.8  2.4 73.2  1.8 2015
 75.2  2.0 74.6  2.3 74.2  1.7 2020
 76.0  2.0 75.4  2.2 75.2  1.6 2025
 76.8  1.9 76.2  2.1 76.1  1.6 2030
 77.6  1.9 76.9  2.1 77.1  1.6 2035
 78.4  1.9 77.6  2.0 77.9  1.7 2040
 79.1  1.8 78.3  1.9 78.7  1.7 2045
 79.8  1.8 79.0  1.9 79.5  1.7 2050
 80.5  1.8 79.7  1.9 80.3  1.7 2055
 81.1  1.8 80.3  1.8 80.9  1.8 2060
 81.7  1.8 80.9  1.8 81.6  1.8 2065
 82.3  1.8 81.4  1.8 82.2  1.8 2070
 82.8  1.8 82.0  1.7 82.8  1.8 2075
 83.3  1.8 82.5  1.7 83.4  1.9 2080
 83.8  1.8 83.0  1.7 83.9  1.9 2085
 84.3  1.9 83.5  1.8 84.4  1.9 2090
 84.7  1.9 83.9  1.8 84.9  1.9 2095
 85.1  1.9 84.3  1.8 85.4  1.9 2100", header=T)

require(plotrix)
twoord.stackplot(lx=data$anos, rx=data$anos, 
                 ldata=cbind(data$e0AL, data$e0BR, data$e0CO),
                 rdata=cbind(data$fxAL, data$fxBR, data$fxCO),
                 lcol=c("black","red", "blue"),
                 rcol=c("black","red", "blue"), 
                 ltype=c("l","o","b"),
                 rtype=c("l","o","b"), 
                 lylab="Años de Vida", rylab="Hijos x Mujer", 
                 xlab="Tiempo",
                 main="Mortalidad/Fecundidad:1950–2100",
                 border="grey80")
legend("bottomright", c(paste("Proy:", 
                      c("A. Latina", "Brasil", "Colombia"))), cex=1,
        col=c("black","red", "blue"), lwd=2, bty="n",  
        lty=c(1,1,2), pch=c(NA,1,1) )

Answer 6

एक अन्य विकल्प जो @BenBolker द्वारा स्वीकृत उत्तर के समान है, अंकों के दूसरे सेट को जोड़ते समय मौजूदा भूखंड के निर्देशांक को फिर से परिभाषित कर रहा है।

यहाँ एक न्यूनतम उदाहरण है।

डेटा:

x  <- 1:10
y1 <- rnorm(10, 100, 20)
y2 <- rnorm(10, 1, 1)

भूखंड:

par(mar=c(5,5,5,5)+0.1, las=1)

plot.new()
plot.window(xlim=range(x), ylim=range(y1))
points(x, y1, col="red", pch=19)
axis(1)
axis(2, col.axis="red")
box()

plot.window(xlim=range(x), ylim=range(y2))
points(x, y2, col="limegreen", pch=19)
axis(4, col.axis="limegreen")